Protein–RNA interactions for Protein: P62754

Rps6, 40S ribosomal protein S6, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 249 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rps6P62754 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Rps6P62754 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Rps6P62754 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Rps6P62754 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Rps6P62754 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Rps6P62754 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Rps6P62754 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Rps6P62754 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Rps6P62754 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Rps6P62754 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Rps6P62754 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Rps6P62754 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Rps6P62754 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Rps6P62754 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Rps6P62754 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Rps6P62754 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Rps6P62754 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Rps6P62754 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Rps6P62754 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Rps6P62754 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Rps6P62754 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Rps6P62754 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Rps6P62754 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Rps6P62754 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Rps6P62754 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Rps6P62754 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Rps6P62754 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Rps6P62754 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Rps6P62754 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Rps6P62754 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Rps6P62754 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Rps6P62754 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Rps6P62754 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Rps6P62754 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Rps6P62754 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Rps6P62754 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Rps6P62754 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Rps6P62754 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Rps6P62754 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Rps6P62754 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Rps6P62754 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Rps6P62754 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Rps6P62754 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Rps6P62754 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Rps6P62754 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Rps6P62754 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Rps6P62754 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Rps6P62754 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Rps6P62754 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Rps6P62754 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Rps6P62754 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Rps6P62754 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Rps6P62754 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Rps6P62754 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Rps6P62754 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Rps6P62754 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Rps6P62754 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Rps6P62754 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Rps6P62754 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Rps6P62754 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Rps6P62754 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Rps6P62754 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Rps6P62754 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Rps6P62754 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Rps6P62754 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Rps6P62754 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Rps6P62754 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Rps6P62754 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Rps6P62754 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Rps6P62754 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Rps6P62754 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Rps6P62754 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Rps6P62754 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Rps6P62754 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Rps6P62754 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Rps6P62754 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Rps6P62754 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Rps6P62754 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Rps6P62754 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Rps6P62754 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Rps6P62754 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Rps6P62754 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Rps6P62754 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Rps6P62754 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Rps6P62754 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Rps6P62754 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Rps6P62754 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Rps6P62754 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Rps6P62754 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Rps6P62754 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Rps6P62754 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Rps6P62754 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Rps6P62754 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Rps6P62754 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Rps6P62754 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Rps6P62754 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Rps6P62754 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Rps6P62754 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Rps6P62754 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Rps6P62754 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.4 ms