Protein–RNA interactions for Protein: P62311

Lsm3, U6 snRNA-associated Sm-like protein LSm3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 102 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lsm3P62311 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Lsm3P62311 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Lsm3P62311 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Lsm3P62311 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Lsm3P62311 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Lsm3P62311 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Lsm3P62311 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Lsm3P62311 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Lsm3P62311 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Lsm3P62311 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Lsm3P62311 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Lsm3P62311 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Lsm3P62311 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Lsm3P62311 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Lsm3P62311 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Lsm3P62311 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Lsm3P62311 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Lsm3P62311 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Lsm3P62311 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Lsm3P62311 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Lsm3P62311 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Lsm3P62311 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Lsm3P62311 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Lsm3P62311 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Lsm3P62311 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Lsm3P62311 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Lsm3P62311 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Lsm3P62311 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Lsm3P62311 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Lsm3P62311 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Lsm3P62311 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Lsm3P62311 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Lsm3P62311 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Lsm3P62311 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Lsm3P62311 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Lsm3P62311 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Lsm3P62311 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Lsm3P62311 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Lsm3P62311 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Lsm3P62311 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Lsm3P62311 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Lsm3P62311 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Lsm3P62311 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Lsm3P62311 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Lsm3P62311 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Lsm3P62311 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Lsm3P62311 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Lsm3P62311 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Lsm3P62311 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Lsm3P62311 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Lsm3P62311 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Lsm3P62311 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Lsm3P62311 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Lsm3P62311 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
Lsm3P62311 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Lsm3P62311 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Lsm3P62311 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Lsm3P62311 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Lsm3P62311 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Lsm3P62311 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Lsm3P62311 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Lsm3P62311 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Lsm3P62311 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Lsm3P62311 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Lsm3P62311 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Lsm3P62311 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Lsm3P62311 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Lsm3P62311 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Lsm3P62311 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Lsm3P62311 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Lsm3P62311 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Lsm3P62311 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Lsm3P62311 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Lsm3P62311 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Lsm3P62311 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Lsm3P62311 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Lsm3P62311 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Lsm3P62311 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Lsm3P62311 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Lsm3P62311 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Lsm3P62311 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Lsm3P62311 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Lsm3P62311 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Lsm3P62311 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Lsm3P62311 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Lsm3P62311 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Lsm3P62311 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Lsm3P62311 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Lsm3P62311 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Lsm3P62311 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Lsm3P62311 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Lsm3P62311 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Lsm3P62311 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Lsm3P62311 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Lsm3P62311 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Lsm3P62311 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Lsm3P62311 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Lsm3P62311 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Lsm3P62311 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Lsm3P62311 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.4 ms