Protein–RNA interactions for Protein: P62307

Snrpf, Small nuclear ribonucleoprotein F, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 86 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SnrpfP62307 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SnrpfP62307 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
SnrpfP62307 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SnrpfP62307 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SnrpfP62307 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SnrpfP62307 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SnrpfP62307 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SnrpfP62307 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SnrpfP62307 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SnrpfP62307 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SnrpfP62307 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SnrpfP62307 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SnrpfP62307 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SnrpfP62307 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SnrpfP62307 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SnrpfP62307 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SnrpfP62307 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SnrpfP62307 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SnrpfP62307 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SnrpfP62307 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SnrpfP62307 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
SnrpfP62307 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SnrpfP62307 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SnrpfP62307 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SnrpfP62307 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SnrpfP62307 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SnrpfP62307 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SnrpfP62307 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SnrpfP62307 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
SnrpfP62307 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SnrpfP62307 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SnrpfP62307 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SnrpfP62307 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SnrpfP62307 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SnrpfP62307 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SnrpfP62307 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SnrpfP62307 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SnrpfP62307 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
SnrpfP62307 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SnrpfP62307 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SnrpfP62307 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SnrpfP62307 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
SnrpfP62307 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SnrpfP62307 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SnrpfP62307 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SnrpfP62307 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
SnrpfP62307 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
SnrpfP62307 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC21.32■■□□□ 1
SnrpfP62307 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC21.32■■□□□ 1
SnrpfP62307 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SnrpfP62307 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC21.32■■□□□ 1
SnrpfP62307 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SnrpfP62307 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SnrpfP62307 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
SnrpfP62307 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SnrpfP62307 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SnrpfP62307 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SnrpfP62307 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SnrpfP62307 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
SnrpfP62307 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC21.31■■□□□ 1
SnrpfP62307 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
SnrpfP62307 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SnrpfP62307 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
SnrpfP62307 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
SnrpfP62307 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
SnrpfP62307 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SnrpfP62307 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SnrpfP62307 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SnrpfP62307 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
SnrpfP62307 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SnrpfP62307 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SnrpfP62307 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SnrpfP62307 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
SnrpfP62307 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC21.29■■□□□ 1
SnrpfP62307 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC21.29■■□□□ 1
SnrpfP62307 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC21.29■■□□□ 1
SnrpfP62307 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC21.29■■□□□ 1
SnrpfP62307 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SnrpfP62307 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SnrpfP62307 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
SnrpfP62307 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SnrpfP62307 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SnrpfP62307 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SnrpfP62307 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SnrpfP62307 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
SnrpfP62307 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SnrpfP62307 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SnrpfP62307 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SnrpfP62307 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SnrpfP62307 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SnrpfP62307 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
SnrpfP62307 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SnrpfP62307 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SnrpfP62307 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SnrpfP62307 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SnrpfP62307 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SnrpfP62307 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC21.27■■□□□ 1
SnrpfP62307 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SnrpfP62307 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
SnrpfP62307 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.3 ms