Protein–RNA interactions for Protein: P61969

Lmo4, LIM domain transcription factor LMO4, mousemouse

Predictions only

Length 165 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lmo4P61969 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Lmo4P61969 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Lmo4P61969 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Lmo4P61969 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Lmo4P61969 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Lmo4P61969 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Lmo4P61969 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lmo4P61969 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lmo4P61969 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lmo4P61969 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lmo4P61969 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lmo4P61969 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lmo4P61969 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lmo4P61969 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lmo4P61969 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lmo4P61969 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lmo4P61969 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lmo4P61969 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lmo4P61969 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lmo4P61969 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lmo4P61969 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lmo4P61969 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lmo4P61969 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lmo4P61969 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lmo4P61969 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lmo4P61969 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lmo4P61969 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lmo4P61969 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lmo4P61969 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lmo4P61969 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lmo4P61969 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lmo4P61969 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lmo4P61969 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lmo4P61969 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lmo4P61969 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lmo4P61969 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lmo4P61969 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lmo4P61969 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lmo4P61969 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Lmo4P61969 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Lmo4P61969 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Lmo4P61969 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Lmo4P61969 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Lmo4P61969 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Lmo4P61969 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Lmo4P61969 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lmo4P61969 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lmo4P61969 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lmo4P61969 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lmo4P61969 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lmo4P61969 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lmo4P61969 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lmo4P61969 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lmo4P61969 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lmo4P61969 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lmo4P61969 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Lmo4P61969 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Lmo4P61969 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Lmo4P61969 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Lmo4P61969 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Lmo4P61969 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Lmo4P61969 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Lmo4P61969 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Lmo4P61969 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Lmo4P61969 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Lmo4P61969 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Lmo4P61969 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Lmo4P61969 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lmo4P61969 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lmo4P61969 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lmo4P61969 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lmo4P61969 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lmo4P61969 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lmo4P61969 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lmo4P61969 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lmo4P61969 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lmo4P61969 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lmo4P61969 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lmo4P61969 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lmo4P61969 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lmo4P61969 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lmo4P61969 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lmo4P61969 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lmo4P61969 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Lmo4P61969 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Lmo4P61969 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Lmo4P61969 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Lmo4P61969 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Lmo4P61969 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Lmo4P61969 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Lmo4P61969 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Lmo4P61969 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Lmo4P61969 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Lmo4P61969 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Lmo4P61969 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Lmo4P61969 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Lmo4P61969 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Lmo4P61969 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Lmo4P61969 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Lmo4P61969 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.2 ms