Protein–RNA interactions for Protein: P61622

Itga11, Integrin alpha-11, mousemouse

Predictions only

Length 1,188 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itga11P61622 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Itga11P61622 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Itga11P61622 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Itga11P61622 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Itga11P61622 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Itga11P61622 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Itga11P61622 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Itga11P61622 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Itga11P61622 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Itga11P61622 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Itga11P61622 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Itga11P61622 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Itga11P61622 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Itga11P61622 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Itga11P61622 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Itga11P61622 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Itga11P61622 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Itga11P61622 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Itga11P61622 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Itga11P61622 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Itga11P61622 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Itga11P61622 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Itga11P61622 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Itga11P61622 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Itga11P61622 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Itga11P61622 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Itga11P61622 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Itga11P61622 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Itga11P61622 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Itga11P61622 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Itga11P61622 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Itga11P61622 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Itga11P61622 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Itga11P61622 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Itga11P61622 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Itga11P61622 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Itga11P61622 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Itga11P61622 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Itga11P61622 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Itga11P61622 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Itga11P61622 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Itga11P61622 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Itga11P61622 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Itga11P61622 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Itga11P61622 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Itga11P61622 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Itga11P61622 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Itga11P61622 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Itga11P61622 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Itga11P61622 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Itga11P61622 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Itga11P61622 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Itga11P61622 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Itga11P61622 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Itga11P61622 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Itga11P61622 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Itga11P61622 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Itga11P61622 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
Itga11P61622 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
Itga11P61622 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
Itga11P61622 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Itga11P61622 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Itga11P61622 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Itga11P61622 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Itga11P61622 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Itga11P61622 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Itga11P61622 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Itga11P61622 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Itga11P61622 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Itga11P61622 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Itga11P61622 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Itga11P61622 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Itga11P61622 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Itga11P61622 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
Itga11P61622 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Itga11P61622 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Itga11P61622 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Itga11P61622 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Itga11P61622 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Itga11P61622 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Itga11P61622 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
Itga11P61622 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Itga11P61622 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Itga11P61622 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Itga11P61622 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Itga11P61622 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Itga11P61622 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Itga11P61622 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Itga11P61622 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Itga11P61622 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Itga11P61622 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Itga11P61622 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Itga11P61622 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Itga11P61622 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Itga11P61622 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Itga11P61622 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Itga11P61622 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Itga11P61622 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
Itga11P61622 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Itga11P61622 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.9 ms