Protein–RNA interactions for Protein: P61406

Smg6, Telomerase-binding protein EST1A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,418 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smg6P61406 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.26■■□□□ 1.95
Smg6P61406 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Smg6P61406 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
Smg6P61406 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Smg6P61406 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Smg6P61406 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
Smg6P61406 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Smg6P61406 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
Smg6P61406 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Smg6P61406 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
Smg6P61406 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Smg6P61406 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Smg6P61406 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Smg6P61406 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
Smg6P61406 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Smg6P61406 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
Smg6P61406 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Smg6P61406 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Smg6P61406 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
Smg6P61406 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Smg6P61406 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
Smg6P61406 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
Smg6P61406 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Smg6P61406 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Smg6P61406 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
Smg6P61406 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC27.24■■□□□ 1.95
Smg6P61406 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
Smg6P61406 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Smg6P61406 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Smg6P61406 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Smg6P61406 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Smg6P61406 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Smg6P61406 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Smg6P61406 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Smg6P61406 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Smg6P61406 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
Smg6P61406 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
Smg6P61406 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
Smg6P61406 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
Smg6P61406 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Smg6P61406 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Smg6P61406 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
Smg6P61406 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC27.22■■□□□ 1.95
Smg6P61406 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Smg6P61406 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
Smg6P61406 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
Smg6P61406 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Smg6P61406 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Smg6P61406 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Smg6P61406 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
Smg6P61406 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Smg6P61406 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
Smg6P61406 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
Smg6P61406 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Smg6P61406 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
Smg6P61406 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
Smg6P61406 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Smg6P61406 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
Smg6P61406 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC27.2■■□□□ 1.94
Smg6P61406 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Smg6P61406 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Smg6P61406 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
Smg6P61406 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Smg6P61406 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Smg6P61406 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Smg6P61406 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Smg6P61406 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Smg6P61406 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Smg6P61406 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Smg6P61406 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
Smg6P61406 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Smg6P61406 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Smg6P61406 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
Smg6P61406 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Smg6P61406 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Smg6P61406 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
Smg6P61406 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
Smg6P61406 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Smg6P61406 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
Smg6P61406 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Smg6P61406 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Smg6P61406 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Smg6P61406 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Smg6P61406 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Smg6P61406 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
Smg6P61406 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
Smg6P61406 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Smg6P61406 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
Smg6P61406 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Smg6P61406 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
Smg6P61406 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Smg6P61406 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC27.15■■□□□ 1.94
Smg6P61406 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Smg6P61406 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
Smg6P61406 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
Smg6P61406 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
Smg6P61406 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Smg6P61406 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC27.15■■□□□ 1.94
Smg6P61406 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
Smg6P61406 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.6 ms