Protein–RNA interactions for Protein: P61092

Siah1a, E3 ubiquitin-protein ligase SIAH1A, mousemouse

Predictions only

Length 282 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Siah1aP61092 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Siah1aP61092 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Siah1aP61092 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Siah1aP61092 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Siah1aP61092 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Siah1aP61092 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Siah1aP61092 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Siah1aP61092 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Siah1aP61092 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
Siah1aP61092 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Siah1aP61092 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
Siah1aP61092 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Siah1aP61092 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Siah1aP61092 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Siah1aP61092 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Siah1aP61092 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
Siah1aP61092 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Siah1aP61092 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Siah1aP61092 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Siah1aP61092 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Siah1aP61092 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Siah1aP61092 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Siah1aP61092 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Siah1aP61092 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Siah1aP61092 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Siah1aP61092 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Siah1aP61092 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
Siah1aP61092 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Siah1aP61092 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC23.33■■□□□ 1.32
Siah1aP61092 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Siah1aP61092 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Siah1aP61092 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Siah1aP61092 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Siah1aP61092 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Siah1aP61092 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Siah1aP61092 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Siah1aP61092 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Siah1aP61092 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Siah1aP61092 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
Siah1aP61092 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Siah1aP61092 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Siah1aP61092 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Siah1aP61092 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Siah1aP61092 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Siah1aP61092 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Siah1aP61092 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Siah1aP61092 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Siah1aP61092 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Siah1aP61092 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Siah1aP61092 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Siah1aP61092 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Siah1aP61092 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Siah1aP61092 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Siah1aP61092 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Siah1aP61092 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Siah1aP61092 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Siah1aP61092 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Siah1aP61092 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Siah1aP61092 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Siah1aP61092 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Siah1aP61092 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Siah1aP61092 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Siah1aP61092 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Siah1aP61092 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Siah1aP61092 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Siah1aP61092 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Siah1aP61092 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Siah1aP61092 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Siah1aP61092 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Siah1aP61092 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
Siah1aP61092 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Siah1aP61092 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Siah1aP61092 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Siah1aP61092 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Siah1aP61092 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
Siah1aP61092 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Siah1aP61092 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Siah1aP61092 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
Siah1aP61092 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Siah1aP61092 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Siah1aP61092 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Siah1aP61092 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
Siah1aP61092 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Siah1aP61092 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
Siah1aP61092 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Siah1aP61092 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Siah1aP61092 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Siah1aP61092 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Siah1aP61092 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
Siah1aP61092 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Siah1aP61092 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
Siah1aP61092 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
Siah1aP61092 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Siah1aP61092 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
Siah1aP61092 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Siah1aP61092 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Siah1aP61092 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Siah1aP61092 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Siah1aP61092 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Siah1aP61092 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.2 ms