Protein–RNA interactions for Protein: P60469

Ppfia3, Liprin-alpha-3, mousemouse

Predictions only

Length 1,194 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ppfia3P60469 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ppfia3P60469 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ppfia3P60469 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ppfia3P60469 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
Ppfia3P60469 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ppfia3P60469 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ppfia3P60469 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ppfia3P60469 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ppfia3P60469 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ppfia3P60469 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ppfia3P60469 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ppfia3P60469 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ppfia3P60469 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ppfia3P60469 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ppfia3P60469 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ppfia3P60469 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ppfia3P60469 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ppfia3P60469 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ppfia3P60469 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ppfia3P60469 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ppfia3P60469 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ppfia3P60469 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
Ppfia3P60469 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ppfia3P60469 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ppfia3P60469 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ppfia3P60469 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ppfia3P60469 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ppfia3P60469 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ppfia3P60469 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
Ppfia3P60469 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ppfia3P60469 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ppfia3P60469 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ppfia3P60469 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ppfia3P60469 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ppfia3P60469 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ppfia3P60469 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ppfia3P60469 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ppfia3P60469 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ppfia3P60469 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ppfia3P60469 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ppfia3P60469 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ppfia3P60469 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ppfia3P60469 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ppfia3P60469 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ppfia3P60469 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ppfia3P60469 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ppfia3P60469 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
Ppfia3P60469 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
Ppfia3P60469 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ppfia3P60469 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC23■■□□□ 1.27
Ppfia3P60469 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Ppfia3P60469 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Ppfia3P60469 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Ppfia3P60469 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Ppfia3P60469 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
Ppfia3P60469 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Ppfia3P60469 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Ppfia3P60469 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Ppfia3P60469 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Ppfia3P60469 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Ppfia3P60469 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Ppfia3P60469 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ppfia3P60469 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ppfia3P60469 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ppfia3P60469 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ppfia3P60469 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ppfia3P60469 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ppfia3P60469 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ppfia3P60469 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ppfia3P60469 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ppfia3P60469 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ppfia3P60469 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ppfia3P60469 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ppfia3P60469 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ppfia3P60469 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ppfia3P60469 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ppfia3P60469 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ppfia3P60469 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ppfia3P60469 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ppfia3P60469 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ppfia3P60469 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ppfia3P60469 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ppfia3P60469 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ppfia3P60469 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
Ppfia3P60469 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ppfia3P60469 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ppfia3P60469 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ppfia3P60469 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ppfia3P60469 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ppfia3P60469 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ppfia3P60469 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ppfia3P60469 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ppfia3P60469 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ppfia3P60469 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ppfia3P60469 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ppfia3P60469 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ppfia3P60469 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ppfia3P60469 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ppfia3P60469 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ppfia3P60469 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.5 ms