Protein–RNA interactions for Protein: P59470

Polr3b, DNA-directed RNA polymerase III subunit RPC2, mousemouse

Predictions only

Length 1,133 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Polr3bP59470 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Polr3bP59470 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Polr3bP59470 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Polr3bP59470 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Polr3bP59470 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Polr3bP59470 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Polr3bP59470 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Polr3bP59470 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Polr3bP59470 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Polr3bP59470 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Polr3bP59470 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Polr3bP59470 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Polr3bP59470 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Polr3bP59470 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Polr3bP59470 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Polr3bP59470 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Polr3bP59470 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Polr3bP59470 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Polr3bP59470 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Polr3bP59470 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Polr3bP59470 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Polr3bP59470 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Polr3bP59470 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Polr3bP59470 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Polr3bP59470 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Polr3bP59470 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Polr3bP59470 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Polr3bP59470 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Polr3bP59470 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Polr3bP59470 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Polr3bP59470 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Polr3bP59470 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Polr3bP59470 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Polr3bP59470 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Polr3bP59470 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Polr3bP59470 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Polr3bP59470 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Polr3bP59470 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Polr3bP59470 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Polr3bP59470 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Polr3bP59470 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Polr3bP59470 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Polr3bP59470 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Polr3bP59470 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Polr3bP59470 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Polr3bP59470 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Polr3bP59470 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Polr3bP59470 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Polr3bP59470 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Polr3bP59470 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Polr3bP59470 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Polr3bP59470 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Polr3bP59470 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Polr3bP59470 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Polr3bP59470 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Polr3bP59470 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Polr3bP59470 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Polr3bP59470 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Polr3bP59470 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Polr3bP59470 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Polr3bP59470 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Polr3bP59470 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Polr3bP59470 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Polr3bP59470 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Polr3bP59470 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Polr3bP59470 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Polr3bP59470 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Polr3bP59470 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Polr3bP59470 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Polr3bP59470 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Polr3bP59470 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Polr3bP59470 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Polr3bP59470 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Polr3bP59470 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Polr3bP59470 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Polr3bP59470 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Polr3bP59470 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Polr3bP59470 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Polr3bP59470 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Polr3bP59470 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Polr3bP59470 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Polr3bP59470 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Polr3bP59470 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Polr3bP59470 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Polr3bP59470 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Polr3bP59470 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Polr3bP59470 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Polr3bP59470 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Polr3bP59470 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Polr3bP59470 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Polr3bP59470 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Polr3bP59470 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Polr3bP59470 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Polr3bP59470 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Polr3bP59470 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Polr3bP59470 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Polr3bP59470 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Polr3bP59470 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Polr3bP59470 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Polr3bP59470 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.4 ms