Protein–RNA interactions for Protein: P59242

Cgn, Cingulin, mousemouse

Predictions only

Length 1,191 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CgnP59242 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CgnP59242 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CgnP59242 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CgnP59242 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CgnP59242 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CgnP59242 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CgnP59242 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CgnP59242 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CgnP59242 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CgnP59242 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CgnP59242 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CgnP59242 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CgnP59242 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CgnP59242 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CgnP59242 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CgnP59242 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
CgnP59242 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CgnP59242 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CgnP59242 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CgnP59242 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CgnP59242 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CgnP59242 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CgnP59242 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CgnP59242 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CgnP59242 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CgnP59242 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CgnP59242 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CgnP59242 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CgnP59242 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CgnP59242 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CgnP59242 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CgnP59242 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
CgnP59242 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CgnP59242 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CgnP59242 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CgnP59242 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CgnP59242 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CgnP59242 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
CgnP59242 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CgnP59242 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CgnP59242 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CgnP59242 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
CgnP59242 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
CgnP59242 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CgnP59242 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CgnP59242 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CgnP59242 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CgnP59242 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CgnP59242 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
CgnP59242 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CgnP59242 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CgnP59242 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CgnP59242 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CgnP59242 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CgnP59242 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CgnP59242 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CgnP59242 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CgnP59242 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
CgnP59242 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CgnP59242 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CgnP59242 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CgnP59242 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CgnP59242 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CgnP59242 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CgnP59242 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CgnP59242 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CgnP59242 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CgnP59242 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CgnP59242 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CgnP59242 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CgnP59242 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CgnP59242 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CgnP59242 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CgnP59242 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CgnP59242 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CgnP59242 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CgnP59242 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CgnP59242 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CgnP59242 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CgnP59242 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CgnP59242 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
CgnP59242 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CgnP59242 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CgnP59242 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CgnP59242 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CgnP59242 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CgnP59242 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CgnP59242 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CgnP59242 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CgnP59242 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CgnP59242 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CgnP59242 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CgnP59242 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CgnP59242 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CgnP59242 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
CgnP59242 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CgnP59242 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CgnP59242 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CgnP59242 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
CgnP59242 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.3 ms