Protein–RNA interactions for Protein: P59222

Scarf2, Scavenger receptor class F member 2, mousemouse

Predictions only

Length 833 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scarf2P59222 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Scarf2P59222 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Scarf2P59222 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Scarf2P59222 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Scarf2P59222 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Scarf2P59222 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Scarf2P59222 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Scarf2P59222 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Scarf2P59222 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Scarf2P59222 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Scarf2P59222 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Scarf2P59222 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Scarf2P59222 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
Scarf2P59222 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Scarf2P59222 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Scarf2P59222 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Scarf2P59222 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Scarf2P59222 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Scarf2P59222 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
Scarf2P59222 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Scarf2P59222 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Scarf2P59222 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Scarf2P59222 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Scarf2P59222 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Scarf2P59222 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Scarf2P59222 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Scarf2P59222 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Scarf2P59222 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Scarf2P59222 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Scarf2P59222 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Scarf2P59222 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Scarf2P59222 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Scarf2P59222 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
Scarf2P59222 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Scarf2P59222 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Scarf2P59222 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Scarf2P59222 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Scarf2P59222 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Scarf2P59222 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Scarf2P59222 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Scarf2P59222 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Scarf2P59222 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Scarf2P59222 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Scarf2P59222 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Scarf2P59222 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Scarf2P59222 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Scarf2P59222 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Scarf2P59222 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Scarf2P59222 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Scarf2P59222 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Scarf2P59222 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Scarf2P59222 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Scarf2P59222 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
Scarf2P59222 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Scarf2P59222 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Scarf2P59222 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Scarf2P59222 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Scarf2P59222 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Scarf2P59222 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Scarf2P59222 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Scarf2P59222 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Scarf2P59222 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Scarf2P59222 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Scarf2P59222 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Scarf2P59222 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Scarf2P59222 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Scarf2P59222 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Scarf2P59222 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
Scarf2P59222 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Scarf2P59222 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Scarf2P59222 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Scarf2P59222 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Scarf2P59222 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Scarf2P59222 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Scarf2P59222 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Scarf2P59222 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
Scarf2P59222 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Scarf2P59222 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Scarf2P59222 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Scarf2P59222 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Scarf2P59222 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Scarf2P59222 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Scarf2P59222 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Scarf2P59222 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Scarf2P59222 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Scarf2P59222 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Scarf2P59222 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
Scarf2P59222 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Scarf2P59222 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Scarf2P59222 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
Scarf2P59222 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Scarf2P59222 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Scarf2P59222 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Scarf2P59222 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Scarf2P59222 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Scarf2P59222 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Scarf2P59222 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Scarf2P59222 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Scarf2P59222 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Scarf2P59222 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.7 ms