Protein–RNA interactions for Protein: P59048

Pdrg1, p53 and DNA damage-regulated protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 133 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdrg1P59048 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
Pdrg1P59048 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Pdrg1P59048 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Pdrg1P59048 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Pdrg1P59048 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
Pdrg1P59048 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Pdrg1P59048 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Pdrg1P59048 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Pdrg1P59048 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
Pdrg1P59048 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Pdrg1P59048 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Pdrg1P59048 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Pdrg1P59048 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Pdrg1P59048 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Pdrg1P59048 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Pdrg1P59048 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Pdrg1P59048 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Pdrg1P59048 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Pdrg1P59048 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
Pdrg1P59048 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Pdrg1P59048 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Pdrg1P59048 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Pdrg1P59048 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Pdrg1P59048 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Pdrg1P59048 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Pdrg1P59048 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Pdrg1P59048 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Pdrg1P59048 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Pdrg1P59048 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Pdrg1P59048 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Pdrg1P59048 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Pdrg1P59048 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Pdrg1P59048 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Pdrg1P59048 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Pdrg1P59048 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Pdrg1P59048 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Pdrg1P59048 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Pdrg1P59048 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
Pdrg1P59048 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Pdrg1P59048 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Pdrg1P59048 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Pdrg1P59048 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Pdrg1P59048 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Pdrg1P59048 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Pdrg1P59048 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Pdrg1P59048 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Pdrg1P59048 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Pdrg1P59048 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Pdrg1P59048 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Pdrg1P59048 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Pdrg1P59048 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Pdrg1P59048 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
Pdrg1P59048 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Pdrg1P59048 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Pdrg1P59048 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Pdrg1P59048 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Pdrg1P59048 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Pdrg1P59048 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Pdrg1P59048 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Pdrg1P59048 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Pdrg1P59048 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Pdrg1P59048 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Pdrg1P59048 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Pdrg1P59048 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Pdrg1P59048 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Pdrg1P59048 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Pdrg1P59048 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Pdrg1P59048 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Pdrg1P59048 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Pdrg1P59048 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Pdrg1P59048 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Pdrg1P59048 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Pdrg1P59048 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Pdrg1P59048 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Pdrg1P59048 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Pdrg1P59048 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Pdrg1P59048 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Pdrg1P59048 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Pdrg1P59048 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Pdrg1P59048 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Pdrg1P59048 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Pdrg1P59048 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Pdrg1P59048 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Pdrg1P59048 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Pdrg1P59048 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Pdrg1P59048 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
Pdrg1P59048 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Pdrg1P59048 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Pdrg1P59048 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Pdrg1P59048 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Pdrg1P59048 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Pdrg1P59048 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Pdrg1P59048 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Pdrg1P59048 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Pdrg1P59048 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Pdrg1P59048 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
Pdrg1P59048 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Pdrg1P59048 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Pdrg1P59048 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Pdrg1P59048 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.2 ms