Protein–RNA interactions for Protein: P58749

Tm6sf1, Transmembrane 6 superfamily member 1, mousemouse

Predictions only

Length 370 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tm6sf1P58749 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Tm6sf1P58749 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Tm6sf1P58749 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Tm6sf1P58749 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Tm6sf1P58749 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
Tm6sf1P58749 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Tm6sf1P58749 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Tm6sf1P58749 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Tm6sf1P58749 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Tm6sf1P58749 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Tm6sf1P58749 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Tm6sf1P58749 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Tm6sf1P58749 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Tm6sf1P58749 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Tm6sf1P58749 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
Tm6sf1P58749 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
Tm6sf1P58749 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Tm6sf1P58749 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Tm6sf1P58749 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Tm6sf1P58749 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Tm6sf1P58749 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Tm6sf1P58749 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Tm6sf1P58749 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Tm6sf1P58749 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
Tm6sf1P58749 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Tm6sf1P58749 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Tm6sf1P58749 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Tm6sf1P58749 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Tm6sf1P58749 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Tm6sf1P58749 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Tm6sf1P58749 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Tm6sf1P58749 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Tm6sf1P58749 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Tm6sf1P58749 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Tm6sf1P58749 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Tm6sf1P58749 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Tm6sf1P58749 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Tm6sf1P58749 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Tm6sf1P58749 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
Tm6sf1P58749 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Tm6sf1P58749 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Tm6sf1P58749 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Tm6sf1P58749 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Tm6sf1P58749 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Tm6sf1P58749 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Tm6sf1P58749 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Tm6sf1P58749 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Tm6sf1P58749 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
Tm6sf1P58749 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Tm6sf1P58749 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Tm6sf1P58749 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Tm6sf1P58749 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Tm6sf1P58749 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Tm6sf1P58749 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Tm6sf1P58749 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Tm6sf1P58749 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Tm6sf1P58749 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Tm6sf1P58749 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Tm6sf1P58749 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
Tm6sf1P58749 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Tm6sf1P58749 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Tm6sf1P58749 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Tm6sf1P58749 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Tm6sf1P58749 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Tm6sf1P58749 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Tm6sf1P58749 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.48
Tm6sf1P58749 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Tm6sf1P58749 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Tm6sf1P58749 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Tm6sf1P58749 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Tm6sf1P58749 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Tm6sf1P58749 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Tm6sf1P58749 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Tm6sf1P58749 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Tm6sf1P58749 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Tm6sf1P58749 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Tm6sf1P58749 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
Tm6sf1P58749 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Tm6sf1P58749 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Tm6sf1P58749 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Tm6sf1P58749 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Tm6sf1P58749 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Tm6sf1P58749 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Tm6sf1P58749 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Tm6sf1P58749 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Tm6sf1P58749 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
Tm6sf1P58749 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Tm6sf1P58749 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Tm6sf1P58749 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Tm6sf1P58749 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Tm6sf1P58749 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
Tm6sf1P58749 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
Tm6sf1P58749 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Tm6sf1P58749 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Tm6sf1P58749 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
Tm6sf1P58749 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Tm6sf1P58749 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Tm6sf1P58749 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Tm6sf1P58749 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Tm6sf1P58749 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.3 ms