Protein–RNA interactions for Protein: P58242

Smpdl3b, Acid sphingomyelinase-like phosphodiesterase 3b, mousemouse

Predictions only

Length 456 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smpdl3bP58242 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Smpdl3bP58242 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Smpdl3bP58242 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Smpdl3bP58242 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Smpdl3bP58242 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
Smpdl3bP58242 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
Smpdl3bP58242 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Smpdl3bP58242 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Smpdl3bP58242 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Smpdl3bP58242 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Smpdl3bP58242 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Smpdl3bP58242 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Smpdl3bP58242 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Smpdl3bP58242 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Smpdl3bP58242 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Smpdl3bP58242 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Smpdl3bP58242 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Smpdl3bP58242 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Smpdl3bP58242 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Smpdl3bP58242 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Smpdl3bP58242 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Smpdl3bP58242 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
Smpdl3bP58242 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Smpdl3bP58242 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Smpdl3bP58242 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Smpdl3bP58242 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Smpdl3bP58242 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Smpdl3bP58242 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Smpdl3bP58242 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Smpdl3bP58242 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Smpdl3bP58242 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Smpdl3bP58242 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Smpdl3bP58242 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Smpdl3bP58242 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Smpdl3bP58242 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Smpdl3bP58242 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Smpdl3bP58242 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Smpdl3bP58242 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Smpdl3bP58242 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Smpdl3bP58242 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Smpdl3bP58242 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Smpdl3bP58242 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Smpdl3bP58242 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Smpdl3bP58242 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Smpdl3bP58242 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Smpdl3bP58242 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Smpdl3bP58242 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Smpdl3bP58242 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Smpdl3bP58242 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Smpdl3bP58242 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Smpdl3bP58242 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Smpdl3bP58242 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Smpdl3bP58242 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Smpdl3bP58242 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Smpdl3bP58242 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
Smpdl3bP58242 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Smpdl3bP58242 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Smpdl3bP58242 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Smpdl3bP58242 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Smpdl3bP58242 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Smpdl3bP58242 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Smpdl3bP58242 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Smpdl3bP58242 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Smpdl3bP58242 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.79
Smpdl3bP58242 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
Smpdl3bP58242 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Smpdl3bP58242 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Smpdl3bP58242 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Smpdl3bP58242 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Smpdl3bP58242 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Smpdl3bP58242 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Smpdl3bP58242 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Smpdl3bP58242 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Smpdl3bP58242 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Smpdl3bP58242 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Smpdl3bP58242 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
Smpdl3bP58242 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Smpdl3bP58242 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Smpdl3bP58242 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Smpdl3bP58242 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Smpdl3bP58242 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Smpdl3bP58242 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Smpdl3bP58242 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Smpdl3bP58242 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Smpdl3bP58242 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Smpdl3bP58242 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Smpdl3bP58242 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Smpdl3bP58242 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Smpdl3bP58242 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Smpdl3bP58242 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Smpdl3bP58242 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Smpdl3bP58242 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Smpdl3bP58242 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Smpdl3bP58242 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Smpdl3bP58242 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Smpdl3bP58242 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Smpdl3bP58242 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Smpdl3bP58242 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Smpdl3bP58242 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Smpdl3bP58242 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.1 ms