Protein–RNA interactions for Protein: P57716

Ncstn, Nicastrin, mousemouse

Predictions only

Length 708 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NcstnP57716 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
NcstnP57716 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
NcstnP57716 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC19.88■□□□□ 0.77
NcstnP57716 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
NcstnP57716 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
NcstnP57716 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
NcstnP57716 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
NcstnP57716 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
NcstnP57716 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
NcstnP57716 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
NcstnP57716 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
NcstnP57716 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
NcstnP57716 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
NcstnP57716 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
NcstnP57716 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
NcstnP57716 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
NcstnP57716 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
NcstnP57716 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
NcstnP57716 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
NcstnP57716 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC19.87■□□□□ 0.77
NcstnP57716 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
NcstnP57716 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
NcstnP57716 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
NcstnP57716 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
NcstnP57716 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC19.86■□□□□ 0.77
NcstnP57716 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC19.86■□□□□ 0.77
NcstnP57716 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
NcstnP57716 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
NcstnP57716 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
NcstnP57716 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
NcstnP57716 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
NcstnP57716 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
NcstnP57716 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
NcstnP57716 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
NcstnP57716 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
NcstnP57716 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
NcstnP57716 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
NcstnP57716 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
NcstnP57716 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
NcstnP57716 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
NcstnP57716 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
NcstnP57716 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
NcstnP57716 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
NcstnP57716 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
NcstnP57716 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
NcstnP57716 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
NcstnP57716 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
NcstnP57716 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
NcstnP57716 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
NcstnP57716 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
NcstnP57716 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
NcstnP57716 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
NcstnP57716 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC19.83■□□□□ 0.77
NcstnP57716 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC19.83■□□□□ 0.77
NcstnP57716 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
NcstnP57716 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
NcstnP57716 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
NcstnP57716 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
NcstnP57716 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC19.82■□□□□ 0.76
NcstnP57716 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
NcstnP57716 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
NcstnP57716 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
NcstnP57716 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
NcstnP57716 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
NcstnP57716 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
NcstnP57716 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
NcstnP57716 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC19.81■□□□□ 0.76
NcstnP57716 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
NcstnP57716 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
NcstnP57716 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
NcstnP57716 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
NcstnP57716 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
NcstnP57716 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
NcstnP57716 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
NcstnP57716 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
NcstnP57716 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC19.8■□□□□ 0.76
NcstnP57716 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
NcstnP57716 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
NcstnP57716 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
NcstnP57716 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.8■□□□□ 0.76
NcstnP57716 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
NcstnP57716 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
NcstnP57716 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
NcstnP57716 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
NcstnP57716 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
NcstnP57716 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
NcstnP57716 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
NcstnP57716 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
NcstnP57716 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
NcstnP57716 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC19.79■□□□□ 0.76
NcstnP57716 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
NcstnP57716 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
NcstnP57716 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
NcstnP57716 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
NcstnP57716 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
NcstnP57716 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
NcstnP57716 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
NcstnP57716 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
NcstnP57716 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
NcstnP57716 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.3 ms