Protein–RNA interactions for Protein: P56528

Cd38, ADP-ribosyl cyclase/cyclic ADP-ribose hydrolase 1, mousemouse

Predictions only

Length 304 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd38P56528 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Cd38P56528 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Cd38P56528 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Cd38P56528 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Cd38P56528 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Cd38P56528 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Cd38P56528 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Cd38P56528 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Cd38P56528 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Cd38P56528 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Cd38P56528 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cd38P56528 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cd38P56528 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cd38P56528 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cd38P56528 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cd38P56528 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Cd38P56528 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cd38P56528 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cd38P56528 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cd38P56528 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cd38P56528 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cd38P56528 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cd38P56528 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cd38P56528 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cd38P56528 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cd38P56528 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Cd38P56528 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cd38P56528 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cd38P56528 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cd38P56528 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cd38P56528 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cd38P56528 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cd38P56528 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cd38P56528 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cd38P56528 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cd38P56528 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cd38P56528 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cd38P56528 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cd38P56528 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cd38P56528 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cd38P56528 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cd38P56528 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Cd38P56528 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cd38P56528 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cd38P56528 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cd38P56528 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cd38P56528 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cd38P56528 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cd38P56528 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cd38P56528 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cd38P56528 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cd38P56528 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cd38P56528 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Cd38P56528 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Cd38P56528 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Cd38P56528 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Cd38P56528 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Cd38P56528 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Cd38P56528 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Cd38P56528 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Cd38P56528 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Cd38P56528 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Cd38P56528 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Cd38P56528 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Cd38P56528 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Cd38P56528 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Cd38P56528 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cd38P56528 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cd38P56528 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cd38P56528 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Cd38P56528 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cd38P56528 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cd38P56528 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cd38P56528 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cd38P56528 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cd38P56528 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Cd38P56528 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cd38P56528 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cd38P56528 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cd38P56528 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cd38P56528 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cd38P56528 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cd38P56528 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cd38P56528 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cd38P56528 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cd38P56528 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cd38P56528 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cd38P56528 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cd38P56528 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cd38P56528 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cd38P56528 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cd38P56528 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cd38P56528 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cd38P56528 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cd38P56528 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cd38P56528 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cd38P56528 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cd38P56528 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cd38P56528 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cd38P56528 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.2 ms