Protein–RNA interactions for Protein: P56399

Usp5, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 5, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 858 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp5P56399 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Usp5P56399 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Usp5P56399 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Usp5P56399 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Usp5P56399 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Usp5P56399 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Usp5P56399 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Usp5P56399 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Usp5P56399 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Usp5P56399 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Usp5P56399 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Usp5P56399 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Usp5P56399 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
Usp5P56399 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Usp5P56399 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Usp5P56399 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Usp5P56399 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Usp5P56399 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Usp5P56399 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Usp5P56399 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
Usp5P56399 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Usp5P56399 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Usp5P56399 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Usp5P56399 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Usp5P56399 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
Usp5P56399 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Usp5P56399 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Usp5P56399 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Usp5P56399 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Usp5P56399 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Usp5P56399 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Usp5P56399 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Usp5P56399 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Usp5P56399 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Usp5P56399 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
Usp5P56399 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Usp5P56399 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Usp5P56399 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Usp5P56399 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Usp5P56399 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Usp5P56399 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Usp5P56399 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Usp5P56399 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Usp5P56399 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Usp5P56399 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Usp5P56399 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Usp5P56399 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Usp5P56399 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Usp5P56399 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Usp5P56399 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Usp5P56399 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Usp5P56399 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Usp5P56399 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Usp5P56399 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Usp5P56399 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Usp5P56399 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Usp5P56399 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
Usp5P56399 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Usp5P56399 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Usp5P56399 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
Usp5P56399 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Usp5P56399 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Usp5P56399 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Usp5P56399 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Usp5P56399 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Usp5P56399 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Usp5P56399 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Usp5P56399 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Usp5P56399 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Usp5P56399 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Usp5P56399 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Usp5P56399 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
Usp5P56399 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Usp5P56399 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Usp5P56399 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Usp5P56399 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Usp5P56399 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
Usp5P56399 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Usp5P56399 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Usp5P56399 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Usp5P56399 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Usp5P56399 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Usp5P56399 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Usp5P56399 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Usp5P56399 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
Usp5P56399 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Usp5P56399 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Usp5P56399 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Usp5P56399 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Usp5P56399 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Usp5P56399 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Usp5P56399 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Usp5P56399 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Usp5P56399 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Usp5P56399 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Usp5P56399 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Usp5P56399 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Usp5P56399 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Usp5P56399 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Usp5P56399 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.2 ms