Protein–RNA interactions for Protein: P56391

Cox6b1, Cytochrome c oxidase subunit 6B1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 86 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cox6b1P56391 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cox6b1P56391 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cox6b1P56391 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cox6b1P56391 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cox6b1P56391 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cox6b1P56391 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cox6b1P56391 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cox6b1P56391 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cox6b1P56391 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cox6b1P56391 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cox6b1P56391 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cox6b1P56391 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cox6b1P56391 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cox6b1P56391 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Cox6b1P56391 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cox6b1P56391 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cox6b1P56391 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cox6b1P56391 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cox6b1P56391 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cox6b1P56391 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cox6b1P56391 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cox6b1P56391 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cox6b1P56391 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cox6b1P56391 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cox6b1P56391 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cox6b1P56391 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cox6b1P56391 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cox6b1P56391 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cox6b1P56391 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cox6b1P56391 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cox6b1P56391 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cox6b1P56391 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cox6b1P56391 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Cox6b1P56391 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Cox6b1P56391 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Cox6b1P56391 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Cox6b1P56391 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cox6b1P56391 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cox6b1P56391 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cox6b1P56391 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cox6b1P56391 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cox6b1P56391 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cox6b1P56391 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cox6b1P56391 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Cox6b1P56391 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cox6b1P56391 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Cox6b1P56391 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cox6b1P56391 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cox6b1P56391 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cox6b1P56391 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cox6b1P56391 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cox6b1P56391 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cox6b1P56391 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cox6b1P56391 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cox6b1P56391 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cox6b1P56391 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cox6b1P56391 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cox6b1P56391 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cox6b1P56391 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cox6b1P56391 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Cox6b1P56391 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cox6b1P56391 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cox6b1P56391 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cox6b1P56391 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cox6b1P56391 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cox6b1P56391 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cox6b1P56391 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cox6b1P56391 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cox6b1P56391 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cox6b1P56391 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cox6b1P56391 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cox6b1P56391 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cox6b1P56391 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cox6b1P56391 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cox6b1P56391 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cox6b1P56391 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cox6b1P56391 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cox6b1P56391 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cox6b1P56391 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cox6b1P56391 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cox6b1P56391 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cox6b1P56391 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cox6b1P56391 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cox6b1P56391 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Cox6b1P56391 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cox6b1P56391 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cox6b1P56391 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cox6b1P56391 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cox6b1P56391 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cox6b1P56391 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cox6b1P56391 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cox6b1P56391 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cox6b1P56391 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cox6b1P56391 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cox6b1P56391 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cox6b1P56391 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cox6b1P56391 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Cox6b1P56391 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cox6b1P56391 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cox6b1P56391 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.4 ms