Protein–RNA interactions for Protein: P56213

Gfer, FAD-linked sulfhydryl oxidase ALR, mousemouse

Predictions only

Length 198 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GferP56213 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
GferP56213 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
GferP56213 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
GferP56213 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
GferP56213 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
GferP56213 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
GferP56213 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
GferP56213 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
GferP56213 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
GferP56213 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
GferP56213 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
GferP56213 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
GferP56213 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
GferP56213 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
GferP56213 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
GferP56213 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
GferP56213 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
GferP56213 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
GferP56213 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
GferP56213 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
GferP56213 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
GferP56213 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
GferP56213 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
GferP56213 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
GferP56213 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
GferP56213 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
GferP56213 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
GferP56213 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
GferP56213 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
GferP56213 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
GferP56213 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
GferP56213 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
GferP56213 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
GferP56213 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
GferP56213 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
GferP56213 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
GferP56213 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
GferP56213 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
GferP56213 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
GferP56213 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
GferP56213 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
GferP56213 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
GferP56213 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
GferP56213 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
GferP56213 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
GferP56213 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
GferP56213 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
GferP56213 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
GferP56213 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
GferP56213 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
GferP56213 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
GferP56213 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
GferP56213 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
GferP56213 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
GferP56213 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
GferP56213 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
GferP56213 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
GferP56213 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
GferP56213 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
GferP56213 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
GferP56213 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
GferP56213 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
GferP56213 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
GferP56213 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
GferP56213 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
GferP56213 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
GferP56213 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
GferP56213 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
GferP56213 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
GferP56213 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
GferP56213 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
GferP56213 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
GferP56213 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
GferP56213 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
GferP56213 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
GferP56213 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
GferP56213 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
GferP56213 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
GferP56213 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
GferP56213 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
GferP56213 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
GferP56213 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
GferP56213 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
GferP56213 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
GferP56213 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
GferP56213 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
GferP56213 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
GferP56213 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
GferP56213 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
GferP56213 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
GferP56213 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
GferP56213 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
GferP56213 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
GferP56213 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
GferP56213 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
GferP56213 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
GferP56213 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
GferP56213 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
GferP56213 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
GferP56213 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.3 ms