Protein–RNA interactions for Protein: P54728

Rad23b, UV excision repair protein RAD23 homolog B, mousemouse

Predictions only

Length 416 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rad23bP54728 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Rad23bP54728 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Rad23bP54728 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Rad23bP54728 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Rad23bP54728 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Rad23bP54728 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Rad23bP54728 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Rad23bP54728 Fxyd5-208ENSMUST00000161805 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Rad23bP54728 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Rad23bP54728 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Rad23bP54728 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Rad23bP54728 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Rad23bP54728 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Rad23bP54728 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Rad23bP54728 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Rad23bP54728 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Rad23bP54728 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Rad23bP54728 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Rad23bP54728 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
Rad23bP54728 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Rad23bP54728 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Rad23bP54728 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Rad23bP54728 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Rad23bP54728 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Rad23bP54728 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Rad23bP54728 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Rad23bP54728 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Rad23bP54728 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Rad23bP54728 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Rad23bP54728 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Rad23bP54728 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
Rad23bP54728 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Rad23bP54728 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Rad23bP54728 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Rad23bP54728 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Rad23bP54728 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Rad23bP54728 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Rad23bP54728 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Rad23bP54728 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Rad23bP54728 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Rad23bP54728 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Rad23bP54728 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Rad23bP54728 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Rad23bP54728 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Rad23bP54728 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Rad23bP54728 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Rad23bP54728 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Rad23bP54728 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Rad23bP54728 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Rad23bP54728 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Rad23bP54728 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Rad23bP54728 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Rad23bP54728 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Rad23bP54728 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Rad23bP54728 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Rad23bP54728 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Rad23bP54728 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Rad23bP54728 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Rad23bP54728 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Rad23bP54728 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Rad23bP54728 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Rad23bP54728 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Rad23bP54728 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Rad23bP54728 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Rad23bP54728 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Rad23bP54728 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Rad23bP54728 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Rad23bP54728 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Rad23bP54728 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Rad23bP54728 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Rad23bP54728 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
Rad23bP54728 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Rad23bP54728 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Rad23bP54728 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Rad23bP54728 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Rad23bP54728 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Rad23bP54728 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Rad23bP54728 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Rad23bP54728 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Rad23bP54728 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Rad23bP54728 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Rad23bP54728 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Rad23bP54728 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Rad23bP54728 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Rad23bP54728 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Rad23bP54728 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Rad23bP54728 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Rad23bP54728 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Rad23bP54728 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Rad23bP54728 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Rad23bP54728 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Rad23bP54728 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Rad23bP54728 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Rad23bP54728 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Rad23bP54728 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Rad23bP54728 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Rad23bP54728 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Rad23bP54728 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
Rad23bP54728 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
Rad23bP54728 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14 ms