Protein–RNA interactions for Protein: P54726

Rad23a, UV excision repair protein RAD23 homolog A, mousemouse

Predictions only

Length 363 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rad23aP54726 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Rad23aP54726 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Rad23aP54726 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Rad23aP54726 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Rad23aP54726 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Rad23aP54726 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Rad23aP54726 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Rad23aP54726 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Rad23aP54726 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Rad23aP54726 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
Rad23aP54726 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Rad23aP54726 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Rad23aP54726 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Rad23aP54726 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Rad23aP54726 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Rad23aP54726 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Rad23aP54726 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Rad23aP54726 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC21.2■□□□□ 0.99
Rad23aP54726 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.99
Rad23aP54726 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Rad23aP54726 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Rad23aP54726 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Rad23aP54726 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Rad23aP54726 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Rad23aP54726 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Rad23aP54726 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Rad23aP54726 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Rad23aP54726 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Rad23aP54726 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Rad23aP54726 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Rad23aP54726 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
Rad23aP54726 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
Rad23aP54726 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Rad23aP54726 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Rad23aP54726 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Rad23aP54726 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Rad23aP54726 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Rad23aP54726 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
Rad23aP54726 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Rad23aP54726 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Rad23aP54726 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Rad23aP54726 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Rad23aP54726 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Rad23aP54726 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Rad23aP54726 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Rad23aP54726 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Rad23aP54726 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Rad23aP54726 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Rad23aP54726 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Rad23aP54726 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Rad23aP54726 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Rad23aP54726 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Rad23aP54726 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Rad23aP54726 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Rad23aP54726 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Rad23aP54726 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Rad23aP54726 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Rad23aP54726 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Rad23aP54726 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Rad23aP54726 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Rad23aP54726 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Rad23aP54726 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Rad23aP54726 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Rad23aP54726 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Rad23aP54726 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Rad23aP54726 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Rad23aP54726 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Rad23aP54726 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Rad23aP54726 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Rad23aP54726 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Rad23aP54726 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.98
Rad23aP54726 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Rad23aP54726 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Rad23aP54726 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
Rad23aP54726 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Rad23aP54726 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Rad23aP54726 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Rad23aP54726 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Rad23aP54726 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Rad23aP54726 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Rad23aP54726 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Rad23aP54726 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Rad23aP54726 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Rad23aP54726 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
Rad23aP54726 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Rad23aP54726 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Rad23aP54726 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Rad23aP54726 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Rad23aP54726 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Rad23aP54726 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Rad23aP54726 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Rad23aP54726 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Rad23aP54726 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Rad23aP54726 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Rad23aP54726 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Rad23aP54726 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Rad23aP54726 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Rad23aP54726 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Rad23aP54726 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Rad23aP54726 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 74.3 ms