Protein–RNA interactions for Protein: P53564

Cux1, Homeobox protein cut-like 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,515 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cux1P53564 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
Cux1P53564 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
Cux1P53564 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC30.88■■■□□ 2.53
Cux1P53564 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
Cux1P53564 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.87■■■□□ 2.53
Cux1P53564 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC30.87■■■□□ 2.53
Cux1P53564 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
Cux1P53564 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
Cux1P53564 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
Cux1P53564 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.86■■■□□ 2.53
Cux1P53564 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC30.86■■■□□ 2.53
Cux1P53564 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
Cux1P53564 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
Cux1P53564 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
Cux1P53564 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
Cux1P53564 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
Cux1P53564 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
Cux1P53564 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
Cux1P53564 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC30.84■■■□□ 2.53
Cux1P53564 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
Cux1P53564 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.84■■■□□ 2.53
Cux1P53564 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
Cux1P53564 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
Cux1P53564 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
Cux1P53564 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
Cux1P53564 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.83■■■□□ 2.53
Cux1P53564 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC30.83■■■□□ 2.53
Cux1P53564 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC30.83■■■□□ 2.53
Cux1P53564 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
Cux1P53564 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
Cux1P53564 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
Cux1P53564 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC30.83■■■□□ 2.53
Cux1P53564 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
Cux1P53564 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC30.83■■■□□ 2.53
Cux1P53564 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
Cux1P53564 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.53
Cux1P53564 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.82■■■□□ 2.52
Cux1P53564 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
Cux1P53564 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.82■■■□□ 2.52
Cux1P53564 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
Cux1P53564 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
Cux1P53564 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC30.81■■■□□ 2.52
Cux1P53564 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC30.81■■■□□ 2.52
Cux1P53564 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
Cux1P53564 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
Cux1P53564 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
Cux1P53564 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
Cux1P53564 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
Cux1P53564 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
Cux1P53564 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC30.8■■■□□ 2.52
Cux1P53564 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.8■■■□□ 2.52
Cux1P53564 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
Cux1P53564 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC30.79■■■□□ 2.52
Cux1P53564 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC30.79■■■□□ 2.52
Cux1P53564 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
Cux1P53564 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC30.79■■■□□ 2.52
Cux1P53564 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
Cux1P53564 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.79■■■□□ 2.52
Cux1P53564 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
Cux1P53564 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
Cux1P53564 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
Cux1P53564 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
Cux1P53564 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
Cux1P53564 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
Cux1P53564 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC30.77■■■□□ 2.52
Cux1P53564 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
Cux1P53564 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.52
Cux1P53564 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.76■■■□□ 2.52
Cux1P53564 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.51
Cux1P53564 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.51
Cux1P53564 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.51
Cux1P53564 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.51
Cux1P53564 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.51
Cux1P53564 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.51
Cux1P53564 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
Cux1P53564 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
Cux1P53564 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
Cux1P53564 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
Cux1P53564 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC30.74■■■□□ 2.51
Cux1P53564 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
Cux1P53564 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
Cux1P53564 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
Cux1P53564 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC30.73■■■□□ 2.51
Cux1P53564 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
Cux1P53564 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC30.73■■■□□ 2.51
Cux1P53564 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC30.73■■■□□ 2.51
Cux1P53564 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
Cux1P53564 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC30.73■■■□□ 2.51
Cux1P53564 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
Cux1P53564 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC30.72■■■□□ 2.51
Cux1P53564 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.72■■■□□ 2.51
Cux1P53564 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
Cux1P53564 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
Cux1P53564 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC30.71■■■□□ 2.51
Cux1P53564 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
Cux1P53564 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.71■■■□□ 2.51
Cux1P53564 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.71■■■□□ 2.51
Cux1P53564 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC30.71■■■□□ 2.51
Cux1P53564 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
Cux1P53564 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.71■■■□□ 2.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.5 ms