Protein–RNA interactions for Protein: P53395

Dbt, Lipoamide acyltransferase component of branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase complex, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 482 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DbtP53395 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
DbtP53395 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
DbtP53395 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
DbtP53395 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
DbtP53395 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
DbtP53395 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.81■□□□□ 0.6
DbtP53395 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
DbtP53395 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
DbtP53395 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
DbtP53395 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
DbtP53395 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
DbtP53395 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
DbtP53395 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
DbtP53395 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
DbtP53395 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
DbtP53395 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
DbtP53395 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
DbtP53395 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
DbtP53395 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
DbtP53395 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
DbtP53395 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
DbtP53395 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
DbtP53395 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
DbtP53395 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
DbtP53395 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
DbtP53395 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
DbtP53395 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
DbtP53395 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
DbtP53395 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
DbtP53395 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
DbtP53395 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC18.79■□□□□ 0.6
DbtP53395 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
DbtP53395 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
DbtP53395 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
DbtP53395 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
DbtP53395 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
DbtP53395 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
DbtP53395 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
DbtP53395 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
DbtP53395 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
DbtP53395 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
DbtP53395 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
DbtP53395 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
DbtP53395 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
DbtP53395 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
DbtP53395 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
DbtP53395 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
DbtP53395 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
DbtP53395 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
DbtP53395 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
DbtP53395 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
DbtP53395 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
DbtP53395 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
DbtP53395 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
DbtP53395 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
DbtP53395 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
DbtP53395 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
DbtP53395 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
DbtP53395 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
DbtP53395 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
DbtP53395 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
DbtP53395 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
DbtP53395 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
DbtP53395 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
DbtP53395 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.59
DbtP53395 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
DbtP53395 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
DbtP53395 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
DbtP53395 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
DbtP53395 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
DbtP53395 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
DbtP53395 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC18.76■□□□□ 0.59
DbtP53395 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
DbtP53395 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
DbtP53395 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
DbtP53395 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
DbtP53395 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
DbtP53395 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
DbtP53395 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
DbtP53395 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
DbtP53395 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
DbtP53395 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
DbtP53395 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
DbtP53395 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
DbtP53395 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
DbtP53395 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
DbtP53395 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
DbtP53395 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
DbtP53395 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
DbtP53395 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
DbtP53395 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
DbtP53395 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
DbtP53395 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
DbtP53395 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
DbtP53395 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
DbtP53395 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
DbtP53395 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
DbtP53395 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
DbtP53395 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
DbtP53395 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.4 ms