Protein–RNA interactions for Protein: P52483

Ube2e3, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 E3, mousemouse

Predictions only

Length 207 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube2e3P52483 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
Ube2e3P52483 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ube2e3P52483 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ube2e3P52483 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ube2e3P52483 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
Ube2e3P52483 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ube2e3P52483 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ube2e3P52483 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ube2e3P52483 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ube2e3P52483 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ube2e3P52483 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ube2e3P52483 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ube2e3P52483 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ube2e3P52483 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ube2e3P52483 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ube2e3P52483 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ube2e3P52483 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ube2e3P52483 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ube2e3P52483 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ube2e3P52483 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ube2e3P52483 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
Ube2e3P52483 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ube2e3P52483 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ube2e3P52483 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ube2e3P52483 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ube2e3P52483 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ube2e3P52483 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ube2e3P52483 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ube2e3P52483 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ube2e3P52483 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ube2e3P52483 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ube2e3P52483 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ube2e3P52483 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ube2e3P52483 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ube2e3P52483 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ube2e3P52483 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ube2e3P52483 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ube2e3P52483 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ube2e3P52483 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ube2e3P52483 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
Ube2e3P52483 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Ube2e3P52483 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Ube2e3P52483 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Ube2e3P52483 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Ube2e3P52483 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Ube2e3P52483 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Ube2e3P52483 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Ube2e3P52483 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Ube2e3P52483 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Ube2e3P52483 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Ube2e3P52483 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ube2e3P52483 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ube2e3P52483 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ube2e3P52483 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ube2e3P52483 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ube2e3P52483 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ube2e3P52483 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ube2e3P52483 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ube2e3P52483 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ube2e3P52483 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ube2e3P52483 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ube2e3P52483 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
Ube2e3P52483 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ube2e3P52483 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ube2e3P52483 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
Ube2e3P52483 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ube2e3P52483 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ube2e3P52483 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ube2e3P52483 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ube2e3P52483 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ube2e3P52483 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ube2e3P52483 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ube2e3P52483 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ube2e3P52483 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ube2e3P52483 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ube2e3P52483 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ube2e3P52483 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ube2e3P52483 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ube2e3P52483 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
Ube2e3P52483 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ube2e3P52483 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ube2e3P52483 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ube2e3P52483 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
Ube2e3P52483 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ube2e3P52483 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ube2e3P52483 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ube2e3P52483 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ube2e3P52483 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ube2e3P52483 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ube2e3P52483 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ube2e3P52483 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ube2e3P52483 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Ube2e3P52483 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
Ube2e3P52483 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Ube2e3P52483 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Ube2e3P52483 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Ube2e3P52483 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Ube2e3P52483 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
Ube2e3P52483 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Ube2e3P52483 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.4 ms