Protein–RNA interactions for Protein: P50586

Tub, Tubby protein, mousemouse

Predictions only

Length 505 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TubP50586 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
TubP50586 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
TubP50586 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
TubP50586 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
TubP50586 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
TubP50586 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
TubP50586 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
TubP50586 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
TubP50586 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
TubP50586 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
TubP50586 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
TubP50586 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
TubP50586 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
TubP50586 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
TubP50586 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
TubP50586 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
TubP50586 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
TubP50586 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
TubP50586 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
TubP50586 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
TubP50586 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
TubP50586 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
TubP50586 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
TubP50586 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
TubP50586 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
TubP50586 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
TubP50586 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
TubP50586 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
TubP50586 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
TubP50586 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
TubP50586 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC20.23■□□□□ 0.83
TubP50586 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
TubP50586 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
TubP50586 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
TubP50586 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
TubP50586 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
TubP50586 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
TubP50586 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
TubP50586 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
TubP50586 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
TubP50586 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
TubP50586 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
TubP50586 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
TubP50586 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
TubP50586 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
TubP50586 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
TubP50586 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
TubP50586 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
TubP50586 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
TubP50586 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
TubP50586 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
TubP50586 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
TubP50586 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
TubP50586 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.83
TubP50586 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
TubP50586 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
TubP50586 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
TubP50586 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
TubP50586 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
TubP50586 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
TubP50586 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC20.2■□□□□ 0.82
TubP50586 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
TubP50586 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC20.2■□□□□ 0.82
TubP50586 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
TubP50586 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
TubP50586 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
TubP50586 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
TubP50586 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
TubP50586 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
TubP50586 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
TubP50586 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
TubP50586 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
TubP50586 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
TubP50586 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
TubP50586 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
TubP50586 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
TubP50586 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
TubP50586 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
TubP50586 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TubP50586 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TubP50586 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
TubP50586 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TubP50586 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
TubP50586 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
TubP50586 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
TubP50586 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TubP50586 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TubP50586 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TubP50586 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TubP50586 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TubP50586 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TubP50586 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TubP50586 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TubP50586 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TubP50586 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
TubP50586 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
TubP50586 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
TubP50586 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
TubP50586 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TubP50586 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.3 ms