Protein–RNA interactions for Protein: P50404

Sftpd, Pulmonary surfactant-associated protein D, mousemouse

Predictions only

Length 374 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SftpdP50404 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
SftpdP50404 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC20.81■□□□□ 0.92
SftpdP50404 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
SftpdP50404 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
SftpdP50404 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
SftpdP50404 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
SftpdP50404 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
SftpdP50404 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
SftpdP50404 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
SftpdP50404 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
SftpdP50404 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
SftpdP50404 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
SftpdP50404 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
SftpdP50404 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
SftpdP50404 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
SftpdP50404 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
SftpdP50404 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
SftpdP50404 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
SftpdP50404 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
SftpdP50404 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
SftpdP50404 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
SftpdP50404 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
SftpdP50404 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
SftpdP50404 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
SftpdP50404 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
SftpdP50404 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
SftpdP50404 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC20.78■□□□□ 0.92
SftpdP50404 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
SftpdP50404 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
SftpdP50404 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
SftpdP50404 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
SftpdP50404 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
SftpdP50404 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
SftpdP50404 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
SftpdP50404 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
SftpdP50404 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
SftpdP50404 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
SftpdP50404 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC20.77■□□□□ 0.92
SftpdP50404 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC20.77■□□□□ 0.92
SftpdP50404 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
SftpdP50404 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
SftpdP50404 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
SftpdP50404 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
SftpdP50404 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
SftpdP50404 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
SftpdP50404 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
SftpdP50404 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
SftpdP50404 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
SftpdP50404 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
SftpdP50404 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
SftpdP50404 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
SftpdP50404 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
SftpdP50404 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
SftpdP50404 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
SftpdP50404 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
SftpdP50404 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
SftpdP50404 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
SftpdP50404 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
SftpdP50404 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
SftpdP50404 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
SftpdP50404 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
SftpdP50404 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
SftpdP50404 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
SftpdP50404 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
SftpdP50404 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
SftpdP50404 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
SftpdP50404 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
SftpdP50404 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
SftpdP50404 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
SftpdP50404 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
SftpdP50404 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
SftpdP50404 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
SftpdP50404 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
SftpdP50404 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
SftpdP50404 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
SftpdP50404 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
SftpdP50404 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
SftpdP50404 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
SftpdP50404 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
SftpdP50404 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
SftpdP50404 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
SftpdP50404 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
SftpdP50404 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
SftpdP50404 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
SftpdP50404 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
SftpdP50404 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
SftpdP50404 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
SftpdP50404 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
SftpdP50404 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
SftpdP50404 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
SftpdP50404 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
SftpdP50404 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
SftpdP50404 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
SftpdP50404 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
SftpdP50404 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
SftpdP50404 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
SftpdP50404 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
SftpdP50404 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
SftpdP50404 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
SftpdP50404 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.9 ms