Protein–RNA interactions for Protein: P49766

Vegfb, Vascular endothelial growth factor B, mousemouse

Predictions only

Length 207 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VegfbP49766 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
VegfbP49766 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
VegfbP49766 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
VegfbP49766 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
VegfbP49766 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
VegfbP49766 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
VegfbP49766 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
VegfbP49766 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
VegfbP49766 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
VegfbP49766 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
VegfbP49766 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
VegfbP49766 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
VegfbP49766 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
VegfbP49766 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
VegfbP49766 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
VegfbP49766 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
VegfbP49766 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
VegfbP49766 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
VegfbP49766 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
VegfbP49766 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
VegfbP49766 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
VegfbP49766 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
VegfbP49766 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
VegfbP49766 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
VegfbP49766 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
VegfbP49766 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
VegfbP49766 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
VegfbP49766 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
VegfbP49766 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
VegfbP49766 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
VegfbP49766 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
VegfbP49766 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
VegfbP49766 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
VegfbP49766 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
VegfbP49766 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
VegfbP49766 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
VegfbP49766 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
VegfbP49766 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
VegfbP49766 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
VegfbP49766 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
VegfbP49766 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
VegfbP49766 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
VegfbP49766 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
VegfbP49766 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
VegfbP49766 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
VegfbP49766 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
VegfbP49766 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
VegfbP49766 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
VegfbP49766 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
VegfbP49766 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
VegfbP49766 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
VegfbP49766 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
VegfbP49766 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
VegfbP49766 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
VegfbP49766 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
VegfbP49766 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
VegfbP49766 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
VegfbP49766 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
VegfbP49766 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
VegfbP49766 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
VegfbP49766 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
VegfbP49766 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
VegfbP49766 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
VegfbP49766 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
VegfbP49766 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
VegfbP49766 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
VegfbP49766 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
VegfbP49766 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
VegfbP49766 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
VegfbP49766 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
VegfbP49766 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
VegfbP49766 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
VegfbP49766 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
VegfbP49766 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
VegfbP49766 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
VegfbP49766 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
VegfbP49766 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
VegfbP49766 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
VegfbP49766 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
VegfbP49766 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
VegfbP49766 1810026B05Rik-205ENSMUST00000184855 409 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
VegfbP49766 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
VegfbP49766 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
VegfbP49766 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
VegfbP49766 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
VegfbP49766 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
VegfbP49766 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
VegfbP49766 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
VegfbP49766 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
VegfbP49766 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
VegfbP49766 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
VegfbP49766 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
VegfbP49766 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
VegfbP49766 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
VegfbP49766 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
VegfbP49766 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
VegfbP49766 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
VegfbP49766 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
VegfbP49766 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
VegfbP49766 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.6 ms