Protein–RNA interactions for Protein: P49135

Ercc3, General transcription and DNA repair factor IIH helicase subunit XPB, mousemouse

Predictions only

Length 783 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ercc3P49135 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ercc3P49135 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ercc3P49135 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ercc3P49135 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ercc3P49135 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ercc3P49135 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ercc3P49135 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ercc3P49135 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ercc3P49135 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ercc3P49135 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ercc3P49135 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
Ercc3P49135 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ercc3P49135 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ercc3P49135 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ercc3P49135 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ercc3P49135 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.34
Ercc3P49135 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
Ercc3P49135 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Ercc3P49135 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC23.39■■□□□ 1.34
Ercc3P49135 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Ercc3P49135 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Ercc3P49135 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
Ercc3P49135 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Ercc3P49135 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Ercc3P49135 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Ercc3P49135 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ercc3P49135 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ercc3P49135 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ercc3P49135 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ercc3P49135 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ercc3P49135 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ercc3P49135 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ercc3P49135 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ercc3P49135 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ercc3P49135 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ercc3P49135 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ercc3P49135 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ercc3P49135 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ercc3P49135 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ercc3P49135 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
Ercc3P49135 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ercc3P49135 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ercc3P49135 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ercc3P49135 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ercc3P49135 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ercc3P49135 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ercc3P49135 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ercc3P49135 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ercc3P49135 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ercc3P49135 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ercc3P49135 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ercc3P49135 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
Ercc3P49135 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ercc3P49135 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ercc3P49135 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ercc3P49135 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ercc3P49135 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
Ercc3P49135 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ercc3P49135 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ercc3P49135 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ercc3P49135 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ercc3P49135 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ercc3P49135 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ercc3P49135 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ercc3P49135 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ercc3P49135 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ercc3P49135 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ercc3P49135 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ercc3P49135 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
Ercc3P49135 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ercc3P49135 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ercc3P49135 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ercc3P49135 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ercc3P49135 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Ercc3P49135 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Ercc3P49135 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Ercc3P49135 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Ercc3P49135 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Ercc3P49135 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Ercc3P49135 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Ercc3P49135 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Ercc3P49135 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
Ercc3P49135 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ercc3P49135 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ercc3P49135 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ercc3P49135 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ercc3P49135 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ercc3P49135 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ercc3P49135 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ercc3P49135 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ercc3P49135 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ercc3P49135 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ercc3P49135 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ercc3P49135 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ercc3P49135 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
Ercc3P49135 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ercc3P49135 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
Ercc3P49135 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ercc3P49135 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ercc3P49135 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.4 ms