Protein–RNA interactions for Protein: P48787

Tnni3, Troponin I, cardiac muscle, mousemouse

Predictions only

Length 211 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnni3P48787 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Tnni3P48787 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Tnni3P48787 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Tnni3P48787 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Tnni3P48787 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Tnni3P48787 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Tnni3P48787 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Tnni3P48787 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Tnni3P48787 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Tnni3P48787 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Tnni3P48787 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
Tnni3P48787 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Tnni3P48787 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Tnni3P48787 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Tnni3P48787 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Tnni3P48787 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Tnni3P48787 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Tnni3P48787 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Tnni3P48787 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Tnni3P48787 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Tnni3P48787 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
Tnni3P48787 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Tnni3P48787 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
Tnni3P48787 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Tnni3P48787 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Tnni3P48787 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Tnni3P48787 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Tnni3P48787 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Tnni3P48787 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Tnni3P48787 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Tnni3P48787 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Tnni3P48787 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Tnni3P48787 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Tnni3P48787 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Tnni3P48787 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Tnni3P48787 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Tnni3P48787 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Tnni3P48787 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
Tnni3P48787 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Tnni3P48787 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Tnni3P48787 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Tnni3P48787 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Tnni3P48787 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Tnni3P48787 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Tnni3P48787 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Tnni3P48787 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Tnni3P48787 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Tnni3P48787 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Tnni3P48787 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Tnni3P48787 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
Tnni3P48787 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Tnni3P48787 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Tnni3P48787 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Tnni3P48787 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Tnni3P48787 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Tnni3P48787 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Tnni3P48787 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Tnni3P48787 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Tnni3P48787 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Tnni3P48787 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Tnni3P48787 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Tnni3P48787 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Tnni3P48787 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Tnni3P48787 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Tnni3P48787 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Tnni3P48787 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Tnni3P48787 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Tnni3P48787 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Tnni3P48787 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Tnni3P48787 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Tnni3P48787 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Tnni3P48787 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Tnni3P48787 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Tnni3P48787 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
Tnni3P48787 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Tnni3P48787 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Tnni3P48787 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Tnni3P48787 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Tnni3P48787 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Tnni3P48787 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Tnni3P48787 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Tnni3P48787 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Tnni3P48787 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Tnni3P48787 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Tnni3P48787 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Tnni3P48787 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Tnni3P48787 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Tnni3P48787 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Tnni3P48787 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Tnni3P48787 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Tnni3P48787 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Tnni3P48787 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Tnni3P48787 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Tnni3P48787 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Tnni3P48787 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Tnni3P48787 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Tnni3P48787 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Tnni3P48787 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Tnni3P48787 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Tnni3P48787 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.8 ms