Protein–RNA interactions for Protein: P48759

Ptx3, Pentraxin-related protein PTX3, mousemouse

Predictions only

Length 381 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptx3P48759 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Ptx3P48759 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ptx3P48759 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ptx3P48759 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ptx3P48759 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ptx3P48759 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ptx3P48759 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ptx3P48759 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ptx3P48759 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Ptx3P48759 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ptx3P48759 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ptx3P48759 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ptx3P48759 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ptx3P48759 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ptx3P48759 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ptx3P48759 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ptx3P48759 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ptx3P48759 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ptx3P48759 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ptx3P48759 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ptx3P48759 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ptx3P48759 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ptx3P48759 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ptx3P48759 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ptx3P48759 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ptx3P48759 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ptx3P48759 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ptx3P48759 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Ptx3P48759 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ptx3P48759 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ptx3P48759 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ptx3P48759 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ptx3P48759 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ptx3P48759 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ptx3P48759 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Ptx3P48759 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ptx3P48759 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ptx3P48759 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Ptx3P48759 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ptx3P48759 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ptx3P48759 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ptx3P48759 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ptx3P48759 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ptx3P48759 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ptx3P48759 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ptx3P48759 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ptx3P48759 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ptx3P48759 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ptx3P48759 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ptx3P48759 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ptx3P48759 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ptx3P48759 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ptx3P48759 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ptx3P48759 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ptx3P48759 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Ptx3P48759 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ptx3P48759 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ptx3P48759 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ptx3P48759 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ptx3P48759 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ptx3P48759 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ptx3P48759 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ptx3P48759 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ptx3P48759 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ptx3P48759 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ptx3P48759 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ptx3P48759 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ptx3P48759 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ptx3P48759 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ptx3P48759 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ptx3P48759 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ptx3P48759 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ptx3P48759 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ptx3P48759 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ptx3P48759 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ptx3P48759 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ptx3P48759 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ptx3P48759 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ptx3P48759 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ptx3P48759 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ptx3P48759 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ptx3P48759 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ptx3P48759 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ptx3P48759 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ptx3P48759 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ptx3P48759 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ptx3P48759 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ptx3P48759 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ptx3P48759 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ptx3P48759 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ptx3P48759 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ptx3P48759 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ptx3P48759 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ptx3P48759 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ptx3P48759 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ptx3P48759 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ptx3P48759 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ptx3P48759 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ptx3P48759 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ptx3P48759 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.8 ms