Protein–RNA interactions for Protein: P47955

Rplp1, 60S acidic ribosomal protein P1, mousemouse

Predictions only

Length 114 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rplp1P47955 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rplp1P47955 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rplp1P47955 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rplp1P47955 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rplp1P47955 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rplp1P47955 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rplp1P47955 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rplp1P47955 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rplp1P47955 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rplp1P47955 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rplp1P47955 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rplp1P47955 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rplp1P47955 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rplp1P47955 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Rplp1P47955 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rplp1P47955 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rplp1P47955 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rplp1P47955 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rplp1P47955 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rplp1P47955 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rplp1P47955 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rplp1P47955 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rplp1P47955 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rplp1P47955 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rplp1P47955 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rplp1P47955 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rplp1P47955 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rplp1P47955 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rplp1P47955 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rplp1P47955 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Rplp1P47955 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rplp1P47955 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rplp1P47955 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rplp1P47955 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rplp1P47955 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rplp1P47955 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rplp1P47955 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rplp1P47955 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Rplp1P47955 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rplp1P47955 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Rplp1P47955 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rplp1P47955 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rplp1P47955 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rplp1P47955 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rplp1P47955 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rplp1P47955 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rplp1P47955 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rplp1P47955 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rplp1P47955 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rplp1P47955 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rplp1P47955 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rplp1P47955 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rplp1P47955 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rplp1P47955 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rplp1P47955 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rplp1P47955 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rplp1P47955 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rplp1P47955 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rplp1P47955 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rplp1P47955 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rplp1P47955 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rplp1P47955 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rplp1P47955 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rplp1P47955 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rplp1P47955 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rplp1P47955 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rplp1P47955 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Rplp1P47955 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rplp1P47955 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rplp1P47955 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rplp1P47955 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rplp1P47955 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rplp1P47955 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rplp1P47955 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rplp1P47955 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rplp1P47955 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rplp1P47955 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Rplp1P47955 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rplp1P47955 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rplp1P47955 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rplp1P47955 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Rplp1P47955 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rplp1P47955 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rplp1P47955 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rplp1P47955 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rplp1P47955 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rplp1P47955 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rplp1P47955 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Rplp1P47955 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rplp1P47955 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rplp1P47955 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rplp1P47955 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rplp1P47955 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rplp1P47955 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rplp1P47955 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rplp1P47955 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Rplp1P47955 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rplp1P47955 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rplp1P47955 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rplp1P47955 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.2 ms