Protein–RNA interactions for Protein: P47915

Rpl29, 60S ribosomal protein L29, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 160 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl29P47915 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rpl29P47915 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rpl29P47915 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rpl29P47915 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rpl29P47915 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rpl29P47915 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rpl29P47915 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rpl29P47915 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rpl29P47915 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rpl29P47915 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rpl29P47915 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rpl29P47915 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rpl29P47915 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rpl29P47915 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rpl29P47915 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rpl29P47915 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rpl29P47915 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rpl29P47915 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rpl29P47915 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rpl29P47915 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rpl29P47915 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rpl29P47915 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Rpl29P47915 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rpl29P47915 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rpl29P47915 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rpl29P47915 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rpl29P47915 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rpl29P47915 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rpl29P47915 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rpl29P47915 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rpl29P47915 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rpl29P47915 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rpl29P47915 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Rpl29P47915 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rpl29P47915 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rpl29P47915 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rpl29P47915 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rpl29P47915 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rpl29P47915 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rpl29P47915 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rpl29P47915 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rpl29P47915 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rpl29P47915 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rpl29P47915 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rpl29P47915 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rpl29P47915 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Rpl29P47915 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Rpl29P47915 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Rpl29P47915 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Rpl29P47915 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rpl29P47915 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rpl29P47915 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rpl29P47915 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rpl29P47915 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rpl29P47915 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rpl29P47915 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rpl29P47915 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rpl29P47915 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rpl29P47915 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rpl29P47915 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rpl29P47915 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rpl29P47915 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rpl29P47915 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rpl29P47915 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rpl29P47915 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rpl29P47915 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rpl29P47915 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rpl29P47915 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rpl29P47915 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rpl29P47915 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rpl29P47915 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rpl29P47915 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rpl29P47915 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rpl29P47915 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rpl29P47915 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rpl29P47915 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rpl29P47915 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rpl29P47915 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rpl29P47915 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rpl29P47915 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rpl29P47915 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rpl29P47915 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rpl29P47915 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rpl29P47915 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rpl29P47915 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rpl29P47915 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rpl29P47915 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rpl29P47915 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rpl29P47915 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rpl29P47915 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rpl29P47915 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Rpl29P47915 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rpl29P47915 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rpl29P47915 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rpl29P47915 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rpl29P47915 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rpl29P47915 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rpl29P47915 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rpl29P47915 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rpl29P47915 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.4 ms