Protein–RNA interactions for Protein: P46684

Zic1, Zinc finger protein ZIC 1, mousemouse

Predictions only

Length 447 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zic1P46684 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Zic1P46684 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Zic1P46684 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Zic1P46684 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Zic1P46684 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Zic1P46684 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Zic1P46684 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Zic1P46684 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Zic1P46684 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Zic1P46684 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Zic1P46684 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Zic1P46684 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Zic1P46684 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Zic1P46684 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Zic1P46684 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Zic1P46684 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Zic1P46684 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Zic1P46684 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Zic1P46684 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Zic1P46684 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Zic1P46684 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Zic1P46684 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Zic1P46684 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Zic1P46684 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Zic1P46684 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Zic1P46684 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Zic1P46684 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Zic1P46684 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Zic1P46684 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Zic1P46684 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
Zic1P46684 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Zic1P46684 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Zic1P46684 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Zic1P46684 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Zic1P46684 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Zic1P46684 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Zic1P46684 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Zic1P46684 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
Zic1P46684 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Zic1P46684 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Zic1P46684 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Zic1P46684 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Zic1P46684 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Zic1P46684 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Zic1P46684 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Zic1P46684 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Zic1P46684 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Zic1P46684 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
Zic1P46684 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Zic1P46684 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Zic1P46684 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Zic1P46684 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Zic1P46684 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Zic1P46684 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Zic1P46684 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Zic1P46684 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Zic1P46684 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Zic1P46684 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Zic1P46684 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
Zic1P46684 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Zic1P46684 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Zic1P46684 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Zic1P46684 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Zic1P46684 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Zic1P46684 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Zic1P46684 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Zic1P46684 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Zic1P46684 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Zic1P46684 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Zic1P46684 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Zic1P46684 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
Zic1P46684 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Zic1P46684 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Zic1P46684 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Zic1P46684 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Zic1P46684 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Zic1P46684 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Zic1P46684 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Zic1P46684 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Zic1P46684 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Zic1P46684 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Zic1P46684 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Zic1P46684 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Zic1P46684 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Zic1P46684 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Zic1P46684 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Zic1P46684 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Zic1P46684 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Zic1P46684 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Zic1P46684 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Zic1P46684 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Zic1P46684 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Zic1P46684 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
Zic1P46684 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Zic1P46684 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Zic1P46684 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Zic1P46684 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Zic1P46684 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Zic1P46684 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Zic1P46684 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.1 ms