Protein–RNA interactions for Protein: P43117

Ptgfr, Prostaglandin F2-alpha receptor, mousemouse

Predictions only

Length 366 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtgfrP43117 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
PtgfrP43117 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
PtgfrP43117 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
PtgfrP43117 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
PtgfrP43117 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
PtgfrP43117 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
PtgfrP43117 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC16.9■□□□□ 0.3
PtgfrP43117 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
PtgfrP43117 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
PtgfrP43117 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
PtgfrP43117 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
PtgfrP43117 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
PtgfrP43117 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
PtgfrP43117 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC16.9■□□□□ 0.3
PtgfrP43117 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
PtgfrP43117 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
PtgfrP43117 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
PtgfrP43117 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
PtgfrP43117 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
PtgfrP43117 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
PtgfrP43117 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
PtgfrP43117 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
PtgfrP43117 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
PtgfrP43117 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
PtgfrP43117 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
PtgfrP43117 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
PtgfrP43117 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
PtgfrP43117 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
PtgfrP43117 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
PtgfrP43117 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
PtgfrP43117 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
PtgfrP43117 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
PtgfrP43117 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
PtgfrP43117 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
PtgfrP43117 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
PtgfrP43117 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
PtgfrP43117 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
PtgfrP43117 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
PtgfrP43117 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
PtgfrP43117 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
PtgfrP43117 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
PtgfrP43117 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
PtgfrP43117 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
PtgfrP43117 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
PtgfrP43117 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
PtgfrP43117 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
PtgfrP43117 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
PtgfrP43117 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
PtgfrP43117 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
PtgfrP43117 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
PtgfrP43117 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
PtgfrP43117 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
PtgfrP43117 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
PtgfrP43117 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
PtgfrP43117 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
PtgfrP43117 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
PtgfrP43117 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
PtgfrP43117 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
PtgfrP43117 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
PtgfrP43117 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
PtgfrP43117 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
PtgfrP43117 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
PtgfrP43117 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
PtgfrP43117 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
PtgfrP43117 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC16.87■□□□□ 0.29
PtgfrP43117 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
PtgfrP43117 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
PtgfrP43117 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
PtgfrP43117 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
PtgfrP43117 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
PtgfrP43117 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
PtgfrP43117 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
PtgfrP43117 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PtgfrP43117 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
PtgfrP43117 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
PtgfrP43117 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
PtgfrP43117 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PtgfrP43117 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
PtgfrP43117 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC16.86■□□□□ 0.29
PtgfrP43117 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
PtgfrP43117 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
PtgfrP43117 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
PtgfrP43117 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PtgfrP43117 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PtgfrP43117 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC16.85■□□□□ 0.29
PtgfrP43117 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
PtgfrP43117 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
PtgfrP43117 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
PtgfrP43117 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PtgfrP43117 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PtgfrP43117 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
PtgfrP43117 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PtgfrP43117 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PtgfrP43117 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PtgfrP43117 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
PtgfrP43117 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PtgfrP43117 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
PtgfrP43117 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PtgfrP43117 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
PtgfrP43117 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.8 ms