Protein–RNA interactions for Protein: P41105

Rpl28, 60S ribosomal protein L28, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 137 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl28P41105 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Rpl28P41105 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Rpl28P41105 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Rpl28P41105 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Rpl28P41105 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Rpl28P41105 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Rpl28P41105 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Rpl28P41105 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Rpl28P41105 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Rpl28P41105 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Rpl28P41105 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
Rpl28P41105 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Rpl28P41105 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Rpl28P41105 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Rpl28P41105 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Rpl28P41105 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Rpl28P41105 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Rpl28P41105 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Rpl28P41105 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Rpl28P41105 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Rpl28P41105 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Rpl28P41105 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Rpl28P41105 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Rpl28P41105 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Rpl28P41105 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Rpl28P41105 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Rpl28P41105 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Rpl28P41105 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Rpl28P41105 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Rpl28P41105 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Rpl28P41105 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Rpl28P41105 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Rpl28P41105 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Rpl28P41105 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Rpl28P41105 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Rpl28P41105 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Rpl28P41105 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Rpl28P41105 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Rpl28P41105 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Rpl28P41105 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Rpl28P41105 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Rpl28P41105 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Rpl28P41105 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Rpl28P41105 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Rpl28P41105 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Rpl28P41105 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Rpl28P41105 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Rpl28P41105 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Rpl28P41105 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Rpl28P41105 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Rpl28P41105 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Rpl28P41105 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Rpl28P41105 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Rpl28P41105 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Rpl28P41105 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Rpl28P41105 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Rpl28P41105 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Rpl28P41105 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Rpl28P41105 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rpl28P41105 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rpl28P41105 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rpl28P41105 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rpl28P41105 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rpl28P41105 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rpl28P41105 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rpl28P41105 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rpl28P41105 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Rpl28P41105 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Rpl28P41105 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rpl28P41105 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rpl28P41105 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rpl28P41105 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rpl28P41105 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rpl28P41105 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rpl28P41105 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rpl28P41105 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rpl28P41105 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rpl28P41105 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rpl28P41105 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rpl28P41105 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rpl28P41105 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rpl28P41105 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rpl28P41105 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rpl28P41105 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rpl28P41105 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rpl28P41105 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rpl28P41105 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rpl28P41105 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rpl28P41105 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rpl28P41105 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rpl28P41105 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rpl28P41105 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rpl28P41105 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rpl28P41105 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rpl28P41105 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rpl28P41105 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rpl28P41105 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rpl28P41105 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Rpl28P41105 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rpl28P41105 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
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