Protein–RNA interactions for Protein: P39087

Grik2, Glutamate receptor ionotropic, kainate 2, mousemouse

Predictions only

Length 908 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grik2P39087 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Grik2P39087 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Grik2P39087 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Grik2P39087 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Grik2P39087 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Grik2P39087 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Grik2P39087 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Grik2P39087 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Grik2P39087 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Grik2P39087 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Grik2P39087 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC19.74■□□□□ 0.75
Grik2P39087 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC19.74■□□□□ 0.75
Grik2P39087 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Grik2P39087 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Grik2P39087 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Grik2P39087 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Grik2P39087 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Grik2P39087 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Grik2P39087 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Grik2P39087 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Grik2P39087 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Grik2P39087 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Grik2P39087 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Grik2P39087 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Grik2P39087 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Grik2P39087 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Grik2P39087 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Grik2P39087 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Grik2P39087 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Grik2P39087 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Grik2P39087 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Grik2P39087 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Grik2P39087 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Grik2P39087 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Grik2P39087 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Grik2P39087 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Grik2P39087 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Grik2P39087 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Grik2P39087 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Grik2P39087 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Grik2P39087 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Grik2P39087 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Grik2P39087 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Grik2P39087 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Grik2P39087 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Grik2P39087 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Grik2P39087 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Grik2P39087 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Grik2P39087 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Grik2P39087 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Grik2P39087 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Grik2P39087 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Grik2P39087 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Grik2P39087 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Grik2P39087 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Grik2P39087 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Grik2P39087 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Grik2P39087 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Grik2P39087 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC19.71■□□□□ 0.75
Grik2P39087 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Grik2P39087 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Grik2P39087 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Grik2P39087 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Grik2P39087 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Grik2P39087 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Grik2P39087 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Grik2P39087 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Grik2P39087 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Grik2P39087 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Grik2P39087 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Grik2P39087 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Grik2P39087 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Grik2P39087 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Grik2P39087 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Grik2P39087 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Grik2P39087 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Grik2P39087 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC19.69■□□□□ 0.74
Grik2P39087 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Grik2P39087 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC19.69■□□□□ 0.74
Grik2P39087 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Grik2P39087 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Grik2P39087 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Grik2P39087 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Grik2P39087 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Grik2P39087 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Grik2P39087 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Grik2P39087 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Grik2P39087 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Grik2P39087 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Grik2P39087 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Grik2P39087 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Grik2P39087 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Grik2P39087 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Grik2P39087 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Grik2P39087 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Grik2P39087 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Grik2P39087 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Grik2P39087 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Grik2P39087 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Grik2P39087 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.2 ms