Protein–RNA interactions for Protein: P38585

Ttl, Tubulin--tyrosine ligase, mousemouse

Predictions only

Length 377 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TtlP38585 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
TtlP38585 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
TtlP38585 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
TtlP38585 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
TtlP38585 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
TtlP38585 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
TtlP38585 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
TtlP38585 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
TtlP38585 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
TtlP38585 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
TtlP38585 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
TtlP38585 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
TtlP38585 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
TtlP38585 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
TtlP38585 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
TtlP38585 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
TtlP38585 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
TtlP38585 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC18.62■□□□□ 0.57
TtlP38585 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
TtlP38585 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
TtlP38585 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
TtlP38585 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
TtlP38585 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
TtlP38585 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
TtlP38585 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
TtlP38585 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
TtlP38585 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
TtlP38585 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
TtlP38585 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
TtlP38585 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
TtlP38585 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
TtlP38585 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
TtlP38585 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
TtlP38585 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
TtlP38585 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
TtlP38585 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
TtlP38585 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
TtlP38585 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
TtlP38585 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
TtlP38585 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
TtlP38585 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
TtlP38585 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
TtlP38585 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
TtlP38585 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
TtlP38585 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
TtlP38585 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
TtlP38585 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
TtlP38585 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
TtlP38585 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
TtlP38585 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
TtlP38585 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
TtlP38585 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
TtlP38585 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
TtlP38585 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
TtlP38585 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
TtlP38585 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC18.59■□□□□ 0.57
TtlP38585 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
TtlP38585 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
TtlP38585 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
TtlP38585 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
TtlP38585 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
TtlP38585 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
TtlP38585 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
TtlP38585 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
TtlP38585 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
TtlP38585 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
TtlP38585 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
TtlP38585 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
TtlP38585 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
TtlP38585 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
TtlP38585 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC18.58■□□□□ 0.56
TtlP38585 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC18.58■□□□□ 0.56
TtlP38585 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
TtlP38585 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
TtlP38585 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC18.58■□□□□ 0.56
TtlP38585 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
TtlP38585 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
TtlP38585 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TtlP38585 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TtlP38585 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TtlP38585 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
TtlP38585 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
TtlP38585 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
TtlP38585 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
TtlP38585 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TtlP38585 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TtlP38585 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TtlP38585 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
TtlP38585 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
TtlP38585 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TtlP38585 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TtlP38585 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
TtlP38585 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
TtlP38585 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TtlP38585 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
TtlP38585 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TtlP38585 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TtlP38585 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TtlP38585 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TtlP38585 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.2 ms