Protein–RNA interactions for Protein: P35822

Ptprk, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase kappa, mousemouse

Predictions only

Length 1,457 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprkP35822 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC32.03■■■□□ 2.72
PtprkP35822 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
PtprkP35822 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
PtprkP35822 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.02■■■□□ 2.72
PtprkP35822 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
PtprkP35822 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.02■■■□□ 2.72
PtprkP35822 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC32.02■■■□□ 2.72
PtprkP35822 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.02■■■□□ 2.72
PtprkP35822 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.01■■■□□ 2.72
PtprkP35822 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.01■■■□□ 2.72
PtprkP35822 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC32.01■■■□□ 2.72
PtprkP35822 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.01■■■□□ 2.71
PtprkP35822 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC32.01■■■□□ 2.71
PtprkP35822 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.01■■■□□ 2.71
PtprkP35822 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.01■■■□□ 2.71
PtprkP35822 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC32.01■■■□□ 2.71
PtprkP35822 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.01■■■□□ 2.71
PtprkP35822 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
PtprkP35822 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
PtprkP35822 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC32■■■□□ 2.71
PtprkP35822 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32■■■□□ 2.71
PtprkP35822 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC32■■■□□ 2.71
PtprkP35822 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC32■■■□□ 2.71
PtprkP35822 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32■■■□□ 2.71
PtprkP35822 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.99■■■□□ 2.71
PtprkP35822 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.99■■■□□ 2.71
PtprkP35822 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.99■■■□□ 2.71
PtprkP35822 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.99■■■□□ 2.71
PtprkP35822 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.99■■■□□ 2.71
PtprkP35822 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.99■■■□□ 2.71
PtprkP35822 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC31.99■■■□□ 2.71
PtprkP35822 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.99■■■□□ 2.71
PtprkP35822 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.99■■■□□ 2.71
PtprkP35822 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC31.99■■■□□ 2.71
PtprkP35822 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC31.98■■■□□ 2.71
PtprkP35822 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC31.98■■■□□ 2.71
PtprkP35822 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.98■■■□□ 2.71
PtprkP35822 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.98■■■□□ 2.71
PtprkP35822 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.98■■■□□ 2.71
PtprkP35822 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.98■■■□□ 2.71
PtprkP35822 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.98■■■□□ 2.71
PtprkP35822 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC31.98■■■□□ 2.71
PtprkP35822 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC31.97■■■□□ 2.71
PtprkP35822 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC31.97■■■□□ 2.71
PtprkP35822 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC31.97■■■□□ 2.71
PtprkP35822 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.97■■■□□ 2.71
PtprkP35822 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.97■■■□□ 2.71
PtprkP35822 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC31.96■■■□□ 2.71
PtprkP35822 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.96■■■□□ 2.71
PtprkP35822 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.96■■■□□ 2.71
PtprkP35822 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC31.96■■■□□ 2.71
PtprkP35822 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.96■■■□□ 2.71
PtprkP35822 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC31.96■■■□□ 2.71
PtprkP35822 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC31.96■■■□□ 2.71
PtprkP35822 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.95■■■□□ 2.71
PtprkP35822 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC31.95■■■□□ 2.71
PtprkP35822 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.95■■■□□ 2.71
PtprkP35822 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.95■■■□□ 2.7
PtprkP35822 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC31.95■■■□□ 2.7
PtprkP35822 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.95■■■□□ 2.7
PtprkP35822 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC31.95■■■□□ 2.7
PtprkP35822 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC31.94■■■□□ 2.7
PtprkP35822 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.94■■■□□ 2.7
PtprkP35822 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC31.94■■■□□ 2.7
PtprkP35822 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.94■■■□□ 2.7
PtprkP35822 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC31.94■■■□□ 2.7
PtprkP35822 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC31.94■■■□□ 2.7
PtprkP35822 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.93■■■□□ 2.7
PtprkP35822 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC31.93■■■□□ 2.7
PtprkP35822 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC31.93■■■□□ 2.7
PtprkP35822 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.93■■■□□ 2.7
PtprkP35822 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC31.93■■■□□ 2.7
PtprkP35822 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC31.93■■■□□ 2.7
PtprkP35822 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.93■■■□□ 2.7
PtprkP35822 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.92■■■□□ 2.7
PtprkP35822 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.92■■■□□ 2.7
PtprkP35822 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.91■■■□□ 2.7
PtprkP35822 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.91■■■□□ 2.7
PtprkP35822 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC31.9■■■□□ 2.7
PtprkP35822 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC31.9■■■□□ 2.7
PtprkP35822 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC31.9■■■□□ 2.7
PtprkP35822 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC31.9■■■□□ 2.7
PtprkP35822 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC31.9■■■□□ 2.7
PtprkP35822 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.89■■■□□ 2.7
PtprkP35822 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.89■■■□□ 2.7
PtprkP35822 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.89■■■□□ 2.7
PtprkP35822 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC31.89■■■□□ 2.7
PtprkP35822 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC31.89■■■□□ 2.7
PtprkP35822 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.89■■■□□ 2.69
PtprkP35822 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.88■■■□□ 2.69
PtprkP35822 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC31.88■■■□□ 2.69
PtprkP35822 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.88■■■□□ 2.69
PtprkP35822 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC31.88■■■□□ 2.69
PtprkP35822 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC31.87■■■□□ 2.69
PtprkP35822 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.87■■■□□ 2.69
PtprkP35822 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.87■■■□□ 2.69
PtprkP35822 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC31.87■■■□□ 2.69
PtprkP35822 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.87■■■□□ 2.69
PtprkP35822 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.87■■■□□ 2.69
PtprkP35822 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.86■■■□□ 2.69
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.7 ms