Protein–RNA interactions for Protein: P35821

Ptpn1, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 1, mousemouse

Predictions only

Length 432 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptpn1P35821 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ptpn1P35821 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ptpn1P35821 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ptpn1P35821 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ptpn1P35821 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ptpn1P35821 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ptpn1P35821 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ptpn1P35821 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ptpn1P35821 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ptpn1P35821 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ptpn1P35821 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Ptpn1P35821 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ptpn1P35821 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ptpn1P35821 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ptpn1P35821 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ptpn1P35821 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ptpn1P35821 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ptpn1P35821 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ptpn1P35821 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ptpn1P35821 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ptpn1P35821 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Ptpn1P35821 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ptpn1P35821 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Ptpn1P35821 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ptpn1P35821 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ptpn1P35821 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ptpn1P35821 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ptpn1P35821 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ptpn1P35821 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ptpn1P35821 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ptpn1P35821 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ptpn1P35821 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ptpn1P35821 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ptpn1P35821 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ptpn1P35821 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ptpn1P35821 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ptpn1P35821 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ptpn1P35821 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ptpn1P35821 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ptpn1P35821 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ptpn1P35821 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ptpn1P35821 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ptpn1P35821 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Ptpn1P35821 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ptpn1P35821 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ptpn1P35821 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ptpn1P35821 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ptpn1P35821 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ptpn1P35821 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Ptpn1P35821 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Ptpn1P35821 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Ptpn1P35821 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Ptpn1P35821 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Ptpn1P35821 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Ptpn1P35821 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Ptpn1P35821 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Ptpn1P35821 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Ptpn1P35821 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Ptpn1P35821 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ptpn1P35821 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ptpn1P35821 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ptpn1P35821 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Ptpn1P35821 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Ptpn1P35821 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ptpn1P35821 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ptpn1P35821 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ptpn1P35821 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ptpn1P35821 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ptpn1P35821 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ptpn1P35821 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ptpn1P35821 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Ptpn1P35821 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ptpn1P35821 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ptpn1P35821 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ptpn1P35821 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ptpn1P35821 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ptpn1P35821 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ptpn1P35821 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ptpn1P35821 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
Ptpn1P35821 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ptpn1P35821 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ptpn1P35821 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ptpn1P35821 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ptpn1P35821 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ptpn1P35821 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ptpn1P35821 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ptpn1P35821 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
Ptpn1P35821 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ptpn1P35821 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ptpn1P35821 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ptpn1P35821 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ptpn1P35821 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ptpn1P35821 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ptpn1P35821 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ptpn1P35821 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ptpn1P35821 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ptpn1P35821 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ptpn1P35821 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ptpn1P35821 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ptpn1P35821 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.1 ms