Protein–RNA interactions for Protein: P35438

Grin1, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 1, mousemouse

Predictions only

Length 938 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grin1P35438 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Grin1P35438 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Grin1P35438 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Grin1P35438 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Grin1P35438 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Grin1P35438 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Grin1P35438 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Grin1P35438 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Grin1P35438 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Grin1P35438 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Grin1P35438 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Grin1P35438 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Grin1P35438 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Grin1P35438 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Grin1P35438 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Grin1P35438 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Grin1P35438 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Grin1P35438 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Grin1P35438 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Grin1P35438 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Grin1P35438 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Grin1P35438 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Grin1P35438 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Grin1P35438 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Grin1P35438 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Grin1P35438 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Grin1P35438 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Grin1P35438 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Grin1P35438 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Grin1P35438 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Grin1P35438 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Grin1P35438 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Grin1P35438 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Grin1P35438 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Grin1P35438 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
Grin1P35438 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Grin1P35438 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Grin1P35438 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Grin1P35438 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Grin1P35438 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Grin1P35438 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Grin1P35438 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Grin1P35438 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Grin1P35438 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Grin1P35438 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Grin1P35438 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Grin1P35438 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Grin1P35438 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Grin1P35438 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Grin1P35438 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Grin1P35438 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Grin1P35438 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Grin1P35438 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Grin1P35438 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Grin1P35438 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Grin1P35438 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Grin1P35438 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Grin1P35438 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Grin1P35438 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Grin1P35438 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Grin1P35438 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Grin1P35438 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Grin1P35438 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Grin1P35438 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Grin1P35438 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Grin1P35438 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Grin1P35438 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Grin1P35438 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Grin1P35438 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Grin1P35438 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Grin1P35438 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Grin1P35438 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Grin1P35438 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Grin1P35438 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Grin1P35438 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Grin1P35438 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Grin1P35438 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Grin1P35438 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Grin1P35438 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Grin1P35438 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Grin1P35438 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Grin1P35438 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Grin1P35438 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Grin1P35438 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Grin1P35438 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Grin1P35438 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Grin1P35438 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Grin1P35438 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Grin1P35438 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Grin1P35438 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Grin1P35438 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Grin1P35438 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Grin1P35438 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Grin1P35438 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Grin1P35438 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Grin1P35438 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Grin1P35438 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Grin1P35438 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Grin1P35438 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Grin1P35438 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.8 ms