Protein–RNA interactions for Protein: P34152

Ptk2, Focal adhesion kinase 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,090 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptk2P34152 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Ptk2P34152 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC20.66■□□□□ 0.9
Ptk2P34152 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Ptk2P34152 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Ptk2P34152 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Ptk2P34152 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Ptk2P34152 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Ptk2P34152 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Ptk2P34152 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Ptk2P34152 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.9
Ptk2P34152 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
Ptk2P34152 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.9
Ptk2P34152 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Ptk2P34152 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Ptk2P34152 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Ptk2P34152 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Ptk2P34152 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Ptk2P34152 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Ptk2P34152 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Ptk2P34152 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Ptk2P34152 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Ptk2P34152 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Ptk2P34152 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Ptk2P34152 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Ptk2P34152 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Ptk2P34152 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Ptk2P34152 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Ptk2P34152 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Ptk2P34152 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Ptk2P34152 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Ptk2P34152 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Ptk2P34152 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Ptk2P34152 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Ptk2P34152 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Ptk2P34152 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Ptk2P34152 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Ptk2P34152 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Ptk2P34152 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Ptk2P34152 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Ptk2P34152 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Ptk2P34152 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Ptk2P34152 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Ptk2P34152 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Ptk2P34152 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Ptk2P34152 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Ptk2P34152 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Ptk2P34152 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Ptk2P34152 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
Ptk2P34152 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Ptk2P34152 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Ptk2P34152 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Ptk2P34152 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Ptk2P34152 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Ptk2P34152 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Ptk2P34152 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Ptk2P34152 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Ptk2P34152 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Ptk2P34152 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Ptk2P34152 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Ptk2P34152 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Ptk2P34152 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Ptk2P34152 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Ptk2P34152 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Ptk2P34152 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Ptk2P34152 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
Ptk2P34152 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Ptk2P34152 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Ptk2P34152 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Ptk2P34152 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Ptk2P34152 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Ptk2P34152 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Ptk2P34152 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Ptk2P34152 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Ptk2P34152 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Ptk2P34152 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Ptk2P34152 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Ptk2P34152 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Ptk2P34152 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Ptk2P34152 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Ptk2P34152 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Ptk2P34152 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Ptk2P34152 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Ptk2P34152 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
Ptk2P34152 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Ptk2P34152 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Ptk2P34152 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Ptk2P34152 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Ptk2P34152 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Ptk2P34152 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Ptk2P34152 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Ptk2P34152 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Ptk2P34152 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Ptk2P34152 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Ptk2P34152 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Ptk2P34152 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Ptk2P34152 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Ptk2P34152 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Ptk2P34152 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Ptk2P34152 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Ptk2P34152 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.9 ms