Protein–RNA interactions for Protein: P34056

Tfap2a, Transcription factor AP-2-alpha, mousemouse

Predictions only

Length 437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tfap2aP34056 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Tfap2aP34056 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Tfap2aP34056 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Tfap2aP34056 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Tfap2aP34056 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Tfap2aP34056 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Tfap2aP34056 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Tfap2aP34056 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Tfap2aP34056 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Tfap2aP34056 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Tfap2aP34056 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Tfap2aP34056 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Tfap2aP34056 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Tfap2aP34056 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Tfap2aP34056 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Tfap2aP34056 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Tfap2aP34056 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Tfap2aP34056 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Tfap2aP34056 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Tfap2aP34056 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Tfap2aP34056 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Tfap2aP34056 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Tfap2aP34056 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Tfap2aP34056 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Tfap2aP34056 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Tfap2aP34056 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Tfap2aP34056 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Tfap2aP34056 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Tfap2aP34056 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Tfap2aP34056 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Tfap2aP34056 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Tfap2aP34056 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC18.58■□□□□ 0.57
Tfap2aP34056 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Tfap2aP34056 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Tfap2aP34056 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Tfap2aP34056 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Tfap2aP34056 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Tfap2aP34056 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Tfap2aP34056 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Tfap2aP34056 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Tfap2aP34056 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Tfap2aP34056 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Tfap2aP34056 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
Tfap2aP34056 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Tfap2aP34056 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Tfap2aP34056 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Tfap2aP34056 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Tfap2aP34056 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Tfap2aP34056 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Tfap2aP34056 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Tfap2aP34056 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Tfap2aP34056 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Tfap2aP34056 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Tfap2aP34056 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Tfap2aP34056 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Tfap2aP34056 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Tfap2aP34056 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Tfap2aP34056 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Tfap2aP34056 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Tfap2aP34056 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Tfap2aP34056 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Tfap2aP34056 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Tfap2aP34056 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Tfap2aP34056 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Tfap2aP34056 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Tfap2aP34056 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Tfap2aP34056 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Tfap2aP34056 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Tfap2aP34056 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Tfap2aP34056 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Tfap2aP34056 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Tfap2aP34056 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Tfap2aP34056 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Tfap2aP34056 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Tfap2aP34056 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Tfap2aP34056 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Tfap2aP34056 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Tfap2aP34056 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Tfap2aP34056 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Tfap2aP34056 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Tfap2aP34056 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Tfap2aP34056 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Tfap2aP34056 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Tfap2aP34056 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Tfap2aP34056 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Tfap2aP34056 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Tfap2aP34056 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Tfap2aP34056 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Tfap2aP34056 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Tfap2aP34056 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Tfap2aP34056 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Tfap2aP34056 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Tfap2aP34056 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Tfap2aP34056 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Tfap2aP34056 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Tfap2aP34056 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Tfap2aP34056 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Tfap2aP34056 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Tfap2aP34056 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Tfap2aP34056 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.7 ms