Protein–RNA interactions for Protein: P33896

Ifnar1, Interferon alpha/beta receptor 1, mousemouse

Predictions only

Length 590 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ifnar1P33896 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ifnar1P33896 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
Ifnar1P33896 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
Ifnar1P33896 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ifnar1P33896 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ifnar1P33896 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ifnar1P33896 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ifnar1P33896 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
Ifnar1P33896 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ifnar1P33896 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ifnar1P33896 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ifnar1P33896 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
Ifnar1P33896 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ifnar1P33896 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ifnar1P33896 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ifnar1P33896 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ifnar1P33896 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ifnar1P33896 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ifnar1P33896 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
Ifnar1P33896 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ifnar1P33896 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ifnar1P33896 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ifnar1P33896 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ifnar1P33896 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ifnar1P33896 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ifnar1P33896 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ifnar1P33896 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
Ifnar1P33896 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
Ifnar1P33896 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ifnar1P33896 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ifnar1P33896 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ifnar1P33896 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ifnar1P33896 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
Ifnar1P33896 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ifnar1P33896 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ifnar1P33896 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ifnar1P33896 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ifnar1P33896 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ifnar1P33896 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ifnar1P33896 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ifnar1P33896 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ifnar1P33896 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ifnar1P33896 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ifnar1P33896 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ifnar1P33896 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ifnar1P33896 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ifnar1P33896 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ifnar1P33896 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ifnar1P33896 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Ifnar1P33896 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Ifnar1P33896 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Ifnar1P33896 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
Ifnar1P33896 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
Ifnar1P33896 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Ifnar1P33896 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Ifnar1P33896 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Ifnar1P33896 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Ifnar1P33896 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ifnar1P33896 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ifnar1P33896 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ifnar1P33896 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ifnar1P33896 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ifnar1P33896 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ifnar1P33896 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ifnar1P33896 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ifnar1P33896 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ifnar1P33896 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ifnar1P33896 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ifnar1P33896 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ifnar1P33896 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ifnar1P33896 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ifnar1P33896 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ifnar1P33896 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ifnar1P33896 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ifnar1P33896 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ifnar1P33896 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
Ifnar1P33896 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ifnar1P33896 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ifnar1P33896 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ifnar1P33896 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ifnar1P33896 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ifnar1P33896 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ifnar1P33896 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ifnar1P33896 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ifnar1P33896 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ifnar1P33896 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ifnar1P33896 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ifnar1P33896 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ifnar1P33896 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ifnar1P33896 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ifnar1P33896 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ifnar1P33896 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ifnar1P33896 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ifnar1P33896 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ifnar1P33896 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ifnar1P33896 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ifnar1P33896 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
Ifnar1P33896 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
Ifnar1P33896 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
Ifnar1P33896 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.3 ms