Protein–RNA interactions for Protein: P32067

Ssb, Lupus La protein homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 415 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SsbP32067 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SsbP32067 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SsbP32067 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SsbP32067 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SsbP32067 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SsbP32067 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SsbP32067 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SsbP32067 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
SsbP32067 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SsbP32067 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SsbP32067 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SsbP32067 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
SsbP32067 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
SsbP32067 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SsbP32067 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SsbP32067 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SsbP32067 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
SsbP32067 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
SsbP32067 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.14
SsbP32067 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SsbP32067 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SsbP32067 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SsbP32067 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SsbP32067 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SsbP32067 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SsbP32067 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
SsbP32067 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SsbP32067 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SsbP32067 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SsbP32067 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SsbP32067 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SsbP32067 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SsbP32067 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SsbP32067 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
SsbP32067 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
SsbP32067 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SsbP32067 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SsbP32067 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SsbP32067 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SsbP32067 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SsbP32067 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
SsbP32067 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SsbP32067 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SsbP32067 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SsbP32067 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SsbP32067 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SsbP32067 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SsbP32067 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SsbP32067 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SsbP32067 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SsbP32067 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SsbP32067 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SsbP32067 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SsbP32067 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SsbP32067 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SsbP32067 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SsbP32067 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SsbP32067 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SsbP32067 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SsbP32067 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SsbP32067 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SsbP32067 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SsbP32067 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SsbP32067 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SsbP32067 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SsbP32067 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SsbP32067 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SsbP32067 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SsbP32067 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
SsbP32067 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
SsbP32067 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
SsbP32067 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
SsbP32067 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
SsbP32067 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
SsbP32067 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
SsbP32067 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SsbP32067 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
SsbP32067 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SsbP32067 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SsbP32067 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SsbP32067 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SsbP32067 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SsbP32067 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SsbP32067 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SsbP32067 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SsbP32067 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SsbP32067 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SsbP32067 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SsbP32067 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SsbP32067 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SsbP32067 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SsbP32067 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SsbP32067 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SsbP32067 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SsbP32067 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SsbP32067 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
SsbP32067 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
SsbP32067 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SsbP32067 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SsbP32067 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.7 ms