Protein–RNA interactions for Protein: P31311

Hoxa11, Homeobox protein Hox-A11, mousemouse

Predictions only

Length 313 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxa11P31311 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Hoxa11P31311 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Hoxa11P31311 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Hoxa11P31311 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Hoxa11P31311 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Hoxa11P31311 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Hoxa11P31311 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Hoxa11P31311 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Hoxa11P31311 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Hoxa11P31311 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Hoxa11P31311 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Hoxa11P31311 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Hoxa11P31311 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Hoxa11P31311 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Hoxa11P31311 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Hoxa11P31311 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Hoxa11P31311 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Hoxa11P31311 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Hoxa11P31311 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Hoxa11P31311 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Hoxa11P31311 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Hoxa11P31311 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Hoxa11P31311 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Hoxa11P31311 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Hoxa11P31311 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Hoxa11P31311 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Hoxa11P31311 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Hoxa11P31311 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Hoxa11P31311 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Hoxa11P31311 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Hoxa11P31311 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Hoxa11P31311 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Hoxa11P31311 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Hoxa11P31311 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Hoxa11P31311 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Hoxa11P31311 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.15
Hoxa11P31311 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Hoxa11P31311 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Hoxa11P31311 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Hoxa11P31311 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Hoxa11P31311 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Hoxa11P31311 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Hoxa11P31311 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Hoxa11P31311 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Hoxa11P31311 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Hoxa11P31311 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Hoxa11P31311 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Hoxa11P31311 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Hoxa11P31311 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Hoxa11P31311 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Hoxa11P31311 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Hoxa11P31311 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Hoxa11P31311 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Hoxa11P31311 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Hoxa11P31311 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Hoxa11P31311 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Hoxa11P31311 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Hoxa11P31311 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Hoxa11P31311 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Hoxa11P31311 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Hoxa11P31311 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Hoxa11P31311 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Hoxa11P31311 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Hoxa11P31311 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Hoxa11P31311 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Hoxa11P31311 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Hoxa11P31311 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Hoxa11P31311 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Hoxa11P31311 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Hoxa11P31311 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Hoxa11P31311 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Hoxa11P31311 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Hoxa11P31311 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Hoxa11P31311 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Hoxa11P31311 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Hoxa11P31311 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Hoxa11P31311 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Hoxa11P31311 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Hoxa11P31311 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Hoxa11P31311 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Hoxa11P31311 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Hoxa11P31311 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Hoxa11P31311 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Hoxa11P31311 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Hoxa11P31311 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Hoxa11P31311 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Hoxa11P31311 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Hoxa11P31311 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Hoxa11P31311 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Hoxa11P31311 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Hoxa11P31311 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Hoxa11P31311 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Hoxa11P31311 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Hoxa11P31311 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Hoxa11P31311 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Hoxa11P31311 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Hoxa11P31311 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC22.14■■□□□ 1.14
Hoxa11P31311 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Hoxa11P31311 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Hoxa11P31311 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC22.14■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.7 ms