Protein–RNA interactions for Protein: P30999

Ctnnd1, Catenin delta-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 938 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctnnd1P30999 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ctnnd1P30999 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ctnnd1P30999 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ctnnd1P30999 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ctnnd1P30999 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ctnnd1P30999 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ctnnd1P30999 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ctnnd1P30999 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ctnnd1P30999 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ctnnd1P30999 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ctnnd1P30999 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ctnnd1P30999 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ctnnd1P30999 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ctnnd1P30999 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
Ctnnd1P30999 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ctnnd1P30999 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ctnnd1P30999 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ctnnd1P30999 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ctnnd1P30999 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ctnnd1P30999 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ctnnd1P30999 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ctnnd1P30999 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
Ctnnd1P30999 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
Ctnnd1P30999 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ctnnd1P30999 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ctnnd1P30999 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ctnnd1P30999 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ctnnd1P30999 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ctnnd1P30999 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ctnnd1P30999 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ctnnd1P30999 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ctnnd1P30999 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ctnnd1P30999 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ctnnd1P30999 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ctnnd1P30999 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ctnnd1P30999 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ctnnd1P30999 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ctnnd1P30999 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ctnnd1P30999 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ctnnd1P30999 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ctnnd1P30999 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ctnnd1P30999 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ctnnd1P30999 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ctnnd1P30999 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ctnnd1P30999 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ctnnd1P30999 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ctnnd1P30999 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ctnnd1P30999 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ctnnd1P30999 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ctnnd1P30999 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ctnnd1P30999 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ctnnd1P30999 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ctnnd1P30999 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ctnnd1P30999 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ctnnd1P30999 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ctnnd1P30999 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ctnnd1P30999 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ctnnd1P30999 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ctnnd1P30999 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ctnnd1P30999 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ctnnd1P30999 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ctnnd1P30999 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ctnnd1P30999 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ctnnd1P30999 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ctnnd1P30999 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ctnnd1P30999 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ctnnd1P30999 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ctnnd1P30999 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ctnnd1P30999 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ctnnd1P30999 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ctnnd1P30999 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ctnnd1P30999 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
Ctnnd1P30999 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ctnnd1P30999 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ctnnd1P30999 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ctnnd1P30999 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ctnnd1P30999 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ctnnd1P30999 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ctnnd1P30999 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ctnnd1P30999 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ctnnd1P30999 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ctnnd1P30999 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ctnnd1P30999 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ctnnd1P30999 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ctnnd1P30999 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ctnnd1P30999 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ctnnd1P30999 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
Ctnnd1P30999 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Ctnnd1P30999 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
Ctnnd1P30999 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Ctnnd1P30999 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Ctnnd1P30999 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Ctnnd1P30999 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Ctnnd1P30999 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Ctnnd1P30999 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Ctnnd1P30999 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Ctnnd1P30999 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Ctnnd1P30999 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Ctnnd1P30999 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Ctnnd1P30999 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.6 ms