Protein–RNA interactions for Protein: P29788

Vtn, Vitronectin, mousemouse

Predictions only

Length 478 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VtnP29788 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
VtnP29788 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
VtnP29788 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
VtnP29788 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
VtnP29788 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
VtnP29788 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
VtnP29788 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
VtnP29788 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
VtnP29788 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
VtnP29788 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
VtnP29788 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
VtnP29788 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
VtnP29788 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
VtnP29788 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
VtnP29788 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
VtnP29788 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
VtnP29788 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
VtnP29788 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.45
VtnP29788 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
VtnP29788 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
VtnP29788 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC17.83■□□□□ 0.45
VtnP29788 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
VtnP29788 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
VtnP29788 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
VtnP29788 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
VtnP29788 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
VtnP29788 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
VtnP29788 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
VtnP29788 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.44
VtnP29788 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
VtnP29788 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
VtnP29788 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
VtnP29788 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
VtnP29788 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
VtnP29788 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
VtnP29788 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
VtnP29788 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
VtnP29788 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
VtnP29788 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
VtnP29788 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
VtnP29788 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
VtnP29788 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
VtnP29788 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
VtnP29788 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
VtnP29788 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
VtnP29788 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
VtnP29788 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
VtnP29788 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
VtnP29788 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
VtnP29788 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
VtnP29788 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
VtnP29788 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
VtnP29788 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
VtnP29788 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
VtnP29788 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
VtnP29788 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
VtnP29788 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
VtnP29788 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
VtnP29788 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
VtnP29788 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
VtnP29788 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
VtnP29788 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
VtnP29788 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
VtnP29788 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
VtnP29788 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
VtnP29788 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
VtnP29788 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
VtnP29788 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
VtnP29788 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
VtnP29788 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
VtnP29788 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
VtnP29788 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
VtnP29788 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
VtnP29788 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
VtnP29788 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
VtnP29788 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
VtnP29788 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
VtnP29788 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
VtnP29788 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
VtnP29788 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
VtnP29788 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
VtnP29788 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
VtnP29788 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
VtnP29788 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
VtnP29788 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
VtnP29788 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
VtnP29788 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
VtnP29788 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
VtnP29788 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
VtnP29788 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
VtnP29788 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
VtnP29788 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
VtnP29788 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
VtnP29788 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
VtnP29788 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
VtnP29788 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
VtnP29788 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
VtnP29788 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
VtnP29788 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
VtnP29788 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.9 ms