Protein–RNA interactions for Protein: P29595

Nedd8, NEDD8, mousemouse

Predictions only

Length 81 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nedd8P29595 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Nedd8P29595 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Nedd8P29595 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Nedd8P29595 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Nedd8P29595 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Nedd8P29595 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Nedd8P29595 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Nedd8P29595 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Nedd8P29595 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Nedd8P29595 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Nedd8P29595 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Nedd8P29595 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Nedd8P29595 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Nedd8P29595 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Nedd8P29595 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Nedd8P29595 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Nedd8P29595 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Nedd8P29595 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Nedd8P29595 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Nedd8P29595 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Nedd8P29595 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Nedd8P29595 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Nedd8P29595 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Nedd8P29595 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Nedd8P29595 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Nedd8P29595 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Nedd8P29595 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Nedd8P29595 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Nedd8P29595 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Nedd8P29595 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Nedd8P29595 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Nedd8P29595 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Nedd8P29595 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Nedd8P29595 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Nedd8P29595 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Nedd8P29595 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Nedd8P29595 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Nedd8P29595 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Nedd8P29595 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Nedd8P29595 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Nedd8P29595 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Nedd8P29595 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Nedd8P29595 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Nedd8P29595 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Nedd8P29595 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Nedd8P29595 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Nedd8P29595 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Nedd8P29595 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Nedd8P29595 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Nedd8P29595 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Nedd8P29595 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Nedd8P29595 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Nedd8P29595 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Nedd8P29595 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Nedd8P29595 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Nedd8P29595 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Nedd8P29595 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Nedd8P29595 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Nedd8P29595 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Nedd8P29595 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Nedd8P29595 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Nedd8P29595 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Nedd8P29595 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Nedd8P29595 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Nedd8P29595 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Nedd8P29595 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Nedd8P29595 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Nedd8P29595 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Nedd8P29595 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Nedd8P29595 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Nedd8P29595 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Nedd8P29595 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Nedd8P29595 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Nedd8P29595 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Nedd8P29595 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Nedd8P29595 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Nedd8P29595 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Nedd8P29595 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Nedd8P29595 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Nedd8P29595 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Nedd8P29595 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Nedd8P29595 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Nedd8P29595 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Nedd8P29595 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Nedd8P29595 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Nedd8P29595 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Nedd8P29595 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Nedd8P29595 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Nedd8P29595 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Nedd8P29595 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Nedd8P29595 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Nedd8P29595 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Nedd8P29595 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Nedd8P29595 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Nedd8P29595 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Nedd8P29595 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Nedd8P29595 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Nedd8P29595 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Nedd8P29595 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Nedd8P29595 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.1 ms