Protein–RNA interactions for Protein: P28575

Ipp, Actin-binding protein IPP, mousemouse

Predictions only

Length 584 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IppP28575 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
IppP28575 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
IppP28575 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
IppP28575 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
IppP28575 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
IppP28575 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
IppP28575 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
IppP28575 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
IppP28575 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
IppP28575 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
IppP28575 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
IppP28575 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
IppP28575 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
IppP28575 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
IppP28575 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
IppP28575 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
IppP28575 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
IppP28575 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
IppP28575 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
IppP28575 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
IppP28575 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
IppP28575 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
IppP28575 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
IppP28575 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
IppP28575 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
IppP28575 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
IppP28575 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
IppP28575 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
IppP28575 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
IppP28575 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
IppP28575 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
IppP28575 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
IppP28575 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
IppP28575 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
IppP28575 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
IppP28575 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
IppP28575 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
IppP28575 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
IppP28575 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
IppP28575 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
IppP28575 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
IppP28575 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
IppP28575 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
IppP28575 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
IppP28575 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
IppP28575 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
IppP28575 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
IppP28575 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
IppP28575 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
IppP28575 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
IppP28575 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
IppP28575 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
IppP28575 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
IppP28575 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
IppP28575 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
IppP28575 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
IppP28575 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
IppP28575 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
IppP28575 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
IppP28575 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
IppP28575 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
IppP28575 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
IppP28575 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
IppP28575 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
IppP28575 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
IppP28575 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
IppP28575 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
IppP28575 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
IppP28575 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
IppP28575 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
IppP28575 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
IppP28575 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
IppP28575 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
IppP28575 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
IppP28575 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
IppP28575 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
IppP28575 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
IppP28575 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
IppP28575 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
IppP28575 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
IppP28575 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
IppP28575 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
IppP28575 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
IppP28575 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
IppP28575 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
IppP28575 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
IppP28575 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
IppP28575 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
IppP28575 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
IppP28575 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
IppP28575 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
IppP28575 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
IppP28575 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
IppP28575 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC21.31■■□□□ 1
IppP28575 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
IppP28575 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
IppP28575 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
IppP28575 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
IppP28575 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
IppP28575 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.2 ms