Protein–RNA interactions for Protein: P28357

Hoxd9, Homeobox protein Hox-D9, mousemouse

Predictions only

Length 339 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd9P28357 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Hoxd9P28357 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Hoxd9P28357 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Hoxd9P28357 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Hoxd9P28357 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Hoxd9P28357 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Hoxd9P28357 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Hoxd9P28357 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Hoxd9P28357 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Hoxd9P28357 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Hoxd9P28357 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Hoxd9P28357 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Hoxd9P28357 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Hoxd9P28357 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Hoxd9P28357 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Hoxd9P28357 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Hoxd9P28357 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Hoxd9P28357 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Hoxd9P28357 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Hoxd9P28357 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Hoxd9P28357 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Hoxd9P28357 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Hoxd9P28357 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Hoxd9P28357 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Hoxd9P28357 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Hoxd9P28357 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Hoxd9P28357 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Hoxd9P28357 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Hoxd9P28357 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Hoxd9P28357 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Hoxd9P28357 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Hoxd9P28357 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Hoxd9P28357 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Hoxd9P28357 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Hoxd9P28357 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Hoxd9P28357 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Hoxd9P28357 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Hoxd9P28357 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Hoxd9P28357 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Hoxd9P28357 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Hoxd9P28357 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Hoxd9P28357 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Hoxd9P28357 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Hoxd9P28357 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Hoxd9P28357 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Hoxd9P28357 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Hoxd9P28357 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Hoxd9P28357 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Hoxd9P28357 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Hoxd9P28357 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Hoxd9P28357 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Hoxd9P28357 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Hoxd9P28357 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Hoxd9P28357 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Hoxd9P28357 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Hoxd9P28357 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Hoxd9P28357 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Hoxd9P28357 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Hoxd9P28357 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Hoxd9P28357 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Hoxd9P28357 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Hoxd9P28357 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Hoxd9P28357 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Hoxd9P28357 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Hoxd9P28357 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Hoxd9P28357 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Hoxd9P28357 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Hoxd9P28357 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Hoxd9P28357 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Hoxd9P28357 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Hoxd9P28357 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Hoxd9P28357 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Hoxd9P28357 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Hoxd9P28357 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Hoxd9P28357 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Hoxd9P28357 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Hoxd9P28357 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Hoxd9P28357 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Hoxd9P28357 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Hoxd9P28357 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Hoxd9P28357 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Hoxd9P28357 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Hoxd9P28357 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Hoxd9P28357 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Hoxd9P28357 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Hoxd9P28357 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Hoxd9P28357 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Hoxd9P28357 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Hoxd9P28357 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Hoxd9P28357 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Hoxd9P28357 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Hoxd9P28357 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Hoxd9P28357 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Hoxd9P28357 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Hoxd9P28357 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Hoxd9P28357 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Hoxd9P28357 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Hoxd9P28357 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Hoxd9P28357 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Hoxd9P28357 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.2 ms